宗地花猪LOX基因CDS区克隆、真核表达载体构建及生物信息学分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王鑫
作者: 王鑫;徐龙鑫;莫本田;武俊达;周文章;张凯凯;李干洲;周迪;杨蓉
作者机构:
关键词: 宗地花猪;LOX基因;克隆;载体构建;生物信息学
期刊名称: 中国畜牧杂志
ISSN: 0258-7033
年卷期: 2023 年 59 卷 012 期
页码: 265-271
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 本研究旨在对宗地花猪LOX(Lysyl Oxidase)基因编码区(Coding Sequence,CDS)区进行克隆和分析,构建其真核表达载体,并对该基因进行生物信息学分析.实验采用RT-PCR克隆方法,以GenBank中公布的猪LOX基因序列为模板,克隆宗地花猪背最长肌组织LOX基因CDS区序列,测序鉴定后进行生物信息学分析,同时构建该基因真核表达载体pEGFP-C1-LOX.结果表明:克隆得到LOX基因CDS区全长 1 260 bp,编码419 个氨基酸,编码蛋白的分子量为 47 009.34 Da,有 45 个磷酸化位点,为无跨膜区域的疏水性蛋白,其核苷酸序列与牛、鸡、黑猩猩、狗、驴、羊、马及人的相似性分别为 90.9%、74.6%、89.2%、91%、91.3%、90.8%、84.4%和44.5%,不同物种间相似性较高,进化过程中具有高度保守性,与牛、羊、驴、狗亲缘关系较近,LOX蛋白主要定位在细胞核.本研究首次克隆出宗地花猪LOX基因CDS区全长序列,并成功构建LOX基因真核表达载体pEGFP-C1-LOX,为进一步探索宗地花猪LOX基因功能及作用机制提供了理论基础.
分类号: S828.2
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