基于RNA-Seq技术挖掘绵羊背最长肌肉质性状相关基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王位

作者： 王位;付绍印;何小龙;王艳欣;王月星;王标;刘斌;刘永斌;张文广

作者机构：

关键词： RNA-Seq;肉质性状;转录组;小尾寒羊;巴美肉羊;背最长肌

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 122-130

收录情况： 北大核心

摘要： 试验通过对小尾寒羊与巴美肉羊背最长肌进行转录组分析,旨在挖掘影响两种绵羊肉质性状的关键基因。分别选取小尾寒羊和巴美肉羊各3只,利用转录组高通量测序(RNA-Seq)技术对其背最长肌转录组文库进行测序,利用生物信息学对测序结果进行分析,筛选影响两者肉质相关的候选基因。结果发现,6个样品测序数据经质量控制后共得到120Gb的有效数据,共筛选出333个差异基因,其中上调基因有82个,下调基因有251个。GO功能富集与KEGG Pathway显著性富集分析结果共筛选了6个与肉质性状相关的候选基因:PDK4、MYF6、PPARGC1A、SLCO4A1、FABP4、LEP。试验通过对比小尾寒羊与巴美肉羊背最长肌转录组数据,筛选影响肉质性状的候选基因,丰富了绵羊基因组信息,为进一步阐述不同品种绵羊肉质性状分子机理奠定了基础。

分类号： S826

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