一株野生灰雁禽流感H9亚型病毒全基因序列的测定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 成进

作者： 成进;沙依兰古丽;夏俊;孟春春;汪萍;陆桂丽;廖明;任涛;史军

作者机构：

关键词： 禽流感H9亚型病毒;新疆;野生鸟类;序列分析

期刊名称： 中国兽医科学

ISSN： 1673-4696

年卷期： 2012 年 10 期

页码： 1002-1006

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究新疆野生灰雁禽流感毒株的基因变异与演化,选择A/Grey goose/XJBZH/1/09(H9N2)株,应用RT-PCR对该毒株的8个基因片段进行了克隆、序列测定与分析。结果,该毒株的HA、NA、NS、M、NP、PB1、PB2和PA这8个基因的核苷酸序列长度分别为1 831、1 548、1 077、1 202、1 705、2 342、2 426和2 319bp。基因序列分析表明,该毒株的HA基因与鸡源毒株A/Chicken/Xinjiang/01/2010(H9N2)的同源率为99.3%;HA和NA基因与鸽源毒株A/pigeon/HongKong/WF53/03(H9N2)的同源率分别为91.5%和91.1%;HA、NA、NS和PB1基因与猪源毒株A/swine/Yangzhou/1/2008(H9N2)的同源率分别为97.5%、97.8%、96.9%和97.5%;NA基因与人源毒株A/Shaoguan/408/98(H9N2)的同源率为93.8%;M、NP、PA和PB2基因与所选的全部参考毒株的同源率均很低。遗传进化分析表明,A/Greygoose/XJBZH/1/09(H9N2)株属于欧亚种系,位于Y280-like亚群。

分类号： S852.659.5

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