基于高密度遗传图谱的水稻萌发耐淹性QTL定位

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙志广

作者： 孙志广;卢百关;刘金波;刘艳;李景芳;迟铭;陈庭木;李健;杨波;刘晓敏;王宝祥;徐大勇

作者机构：

关键词： 杂草稻;萌发耐淹性;高密度遗传图谱;QTL

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN：

年卷期： 2024 年 001 期

页码： 21-29

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 通过对水稻萌发耐淹性进行QTL定位和稳定位点的聚合效应分析,可以为萌发耐淹性基因的精细定位及后续分子辅助育种奠定基础.本研究利用一个包含144份家系的强萌发耐淹性粳型杂草稻WR-4与籼稻品种广百香占的F2:3定位群体,基于1K m GPS SNP芯片构建了一个包含825个Bin标记的高密度遗传图谱,利用完备区间作图法共检测到10个萌发耐淹性QTL,分布于水稻第3、4、7、8、9和10染色体上,LOD值介于3.6~21.3之间,可解释3.0%~21.1%的表型变异.其中,具有较高LOD值和贡献率的2个主效QTL(q GS4-1和q GS7-1)能够被重复检测到,是后续基因克隆的候选位点.根据Bin标记分型结果将不同子代在两个稳定QTL区间内分为WR型和广百香占型,在F2:3群体中进行聚合效应分析,发现聚合增效等位基因数量越多的家系,其淹水条件下的胚芽鞘越长,这些携带多个耐性QTL的株系可为分子育种培育耐低氧萌发水稻新品种提供亲本资源.

分类号： S51

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