甘蓝型油菜组蛋白乙酰转移酶Bn-HAM2基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王建伟

作者： 王建伟;贺晓岚;李文旭;秦绍钊;汤宏;余星

作者机构：

关键词： 油菜;Bn-HAM2基因;克隆;生物信息分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2022 年 20 卷 017 期

页码： 5588-5595

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： HAM2基因在植物生长、发育和应激反应中起重要的调控作用.本研究以油菜品种'美国油王88'和'南油868'为材料,通过PCR技术扩增HAM2完整编码区,利用生物信息软件进行序列分析,并通过PlantCARE对其启动子序列进行分析.结果表明,Bn-HAM2-MY88和Bn-HAM2-NY868的开放阅读框长度均为1 326 bp,编码441个氨基酸,分子量分别约为50.81 kD和50.86 kD,理论等电点分别为7.88和7.56;亚细胞定位预测分析发现该基因编码的蛋白主要分布于细胞核;功能结构域分析结果证实,Bn-HAM2-MY88和Bn-HAM2-NY868蛋白都包含有保守的MYST结构域,属于MYST亚家族成员;多序列比对及进化树分析结果表明,Bn-HAM2-MY88和Bn-HAM2-NY868与NCBI中公布的甘蓝型油菜组蛋白乙酰转移酶氨基酸序列(XP_013715766)相似性最高,分别为99.77%和100%,与拟南芥组蛋白乙酰转移酶序列(KAG7554717.1)相似性高达90%以上;启动子分析表明,除含有真核生物启动子TATA和CAAT固有元件外,还存在W-box、P-box、TGA-element、TC-richrepeats等多种响应逆境胁迫的顺式元件.本研究结果为进一步研究Bn-HAM2-MY88和Bn-HAM2-NY868的生物学功能提供了基础资料.

分类号： S565.4

  • 相关文献

[1]甘蓝型油菜γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶(GCS)基因的克隆及生物信息分析. 贺晓岚,王建伟,陈新宏,李文旭,秦绍钊. 2023

[2]牦牛miR-378前体克隆及组织表达分析. 纪会,王会,柴志欣,王吉坤,罗晓林,姬秋梅,信金伟,钟金城. 2019

[3]两个油菜品系的fad2和sad基因序列差异比较. 龙卫华,浦惠明,陈松,高建芹,胡茂龙,张洁夫,戚存扣. 2011

[4]油菜防卫素和草酸氧化酶基因的克隆与诱导表达水平研究. 刘胜毅,B.D.L.Fitt,刘仁虎,N.Evans,董彩华,黄永菊. 2004

[5]小偃麦异附加系TaTGA4转录因子基因的克隆与生物信息学分析. 牛祖彪,李娜,惠文荣,宋静,黄春丽,高居荣,王洪刚,封德顺. 2015

[6]动物胃肠道菌群的研究进展. 王津,燕晓翠,韩烨,周志江,刘红星,陈宝永,郑成江,邹旸,范寰. 2017

[7]辣椒蔗糖转运蛋白基因生物信息学及表达模式分析. 李宁,尹延旭,王畅,王飞,姚明华,范书云. 2024

[8]转录组荔枝Dof基因家族的鉴定及其表达. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2021

[9]甘蓝型油菜SnRK基因家族生物信息学分析及其与种子含油量的关系. 唐婧泉,王南,高界,刘婷婷,文静,易斌,涂金星,傅廷栋,沈金雄. 2021

[10]番木瓜赖氨酸基序类受体激酶LysM-RLK基因家族鉴定及生物信息学分析. 郭盼,孔华,王雨,戴云素,贾瑞宗,周瑶,郭安平,纪长绵,马春花. 2023

[11]油棕SAUR基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析. 周丽霞,杨蒙迪,曹红星,杨耀东. 2022

[12]番茄20S蛋白酶体基因家族鉴定及生物信息学分析. 闫超凡,孙雪梅,钟启文,邵登魁,邓昌蓉,文军琴. 2024

[13]新型牡蛎相关圆环病毒基因组的鉴定. 杨李玲,郭迎香,位红颖,王萌,方艺菲,朱鹏,姜敬哲. 2022

[14]火龙果F-box基因家族的结构分析及表达鉴定. 王周雯,王猛,丁一,韦双双,谢俊,黄家权,李洪立,胡文斌,汤华. 2023

[15]鸭源H5N1亚型高致病性禽流感病毒的分离鉴定及其HA和NA基因的生物信息分析. 孙恩成,刘春国,侯喜林,刘明,朴范泽. 2009

[16]环境变化对水稻osfh1突变体成蛋白家族表达的影响. 李斌,李明玉,杜志烨,汪开顺,肖凯,王鑫,石杨,姬红丽,陈稷,黄进. 2022

[17]椰子GPAT基因家族的鉴定及生物信息学分析. 周倩倩,张照华,弓淑芳,夏志辉. 2024

[18]小麦TaTVP1基因的克隆与表达分析. 马燕斌,李换丽,文晋,王霞,周仙婷,王新胜. 2023

[19]基于转录组的荔枝ARF基因家族的鉴定及表达分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2017

[20]基于转录组的荔枝XTH家族基因的鉴定及分析. 董晨,魏永赞,王弋,郑雪文,李伟才. 2019

作者其他论文 更多>>

微信小程序