鲤IGF2b基因5'侧翼区序列克隆及不同鲤该区域GC富集区的甲基化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张成锋

作者： 张成锋;苏胜彦;朱健;朱文彬;刘珊;董在杰

作者机构：

关键词： 鲤;IGF2b;5'侧翼区;甲基化

期刊名称： 动物学杂志

ISSN： 0250-3263

年卷期： 2012 年 47 卷 02 期

页码： 100-106

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 鲤(Cyprinus carpio)胰岛素样生长因子2b(insulin-like growth factor 2b,IGF2b)基因为鲤IGF基因家族重要的成员,已有的研究表明5'侧翼区序列对其功能的发挥有重要作用。因此,采用基因组步移法获取5'侧翼区序列,通过亚硫酸盐修饰的方法分析不同品种该区域GC富集区的甲基化状况。本文成功从鲤基因组DNA中获得695 bp的IGF2b 5'侧翼区序列。已获取的IGF2b 5'侧翼区序列经过TFSEARCH分析后发现了多个转录因子结合位点和TATA框,通过BLAST比对发现,鲤IGF2b 5'侧翼区DNA序列与斑马鱼(Danio rerio)IGF2b基因相比,相似性为87%。检测该区域富含GC的序列17个位点,发现建鲤(C.c.var.jian)有2个个体的3个位点出现甲基化,而黄河鲤(C.c.haematopterus)只有1个个体1个位点出现甲基化,这说明2个品种鲤在这个区域出现甲基化修饰的几率低,也验证了这2品种在该基因该区域GC富集区是稳定的。

分类号： S917.4`Q78

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