华南地区牛结节性皮肤病病毒全基因组测序及分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周秀蓉

作者： 周秀蓉;黄敏霞;徐志宏;温肖会;罗胜军;贾春玲;高原;翟颀;吕殿红

作者机构：

关键词： 华南地区;牛结节性皮肤病病毒;全基因组测序

期刊名称： 中国兽医学报

ISSN： 1005-4545

年卷期： 2023 年 002 期

页码： 260-268

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了对2020年我国华南地区牛结节性皮肤病（lumpy skin disease, LSD）疫情进行溯源调查，本研究采用商品化检测试剂盒和透射电镜对2份华南地区疑似感染的牛皮肤结节组织样本进行鉴定，利用高通量测序技术进行病毒全基因组测序，并对其进行序列比对、遗传进化和病毒重组分析。qPCR检测结果显示2份样本均为牛结节性皮肤病病毒（lumpy skin disease virus, LSDV）阳性，电镜观察到典型LSDV病毒粒子形态，将其命名为China/GD02/2020株和China/GX01/2020株，获得全基因组序列上传GenBank获得登录号分别为OM803091和OM803092。对病毒全基因组序列比对及遗传进化分析显示GD02和GX01株的核苷酸相似性达到99.99%,并与2020年中国台湾、中国香港和越南的LSDV分离株处于进化树的同一小分支，且均归属为重组病毒。病毒重组分析表明2株病毒的主要亲本为南非疫苗株（Neethling vaccine LW 1959）,次要亲本为摩洛哥从牛分离的田间株（LSD/KSGP 0240/Morocco/2017）和南非野毒株（Neethling Warmbaths LW）等。本研究对国内LSDV流行毒株的遗传演化、溯源和防控具有借鉴意义。

分类号： S852.65

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