文献类型： 中文期刊
第一作者： 刘畅
作者： 刘畅;孟云;刘金栋;王雅美;Guoyou Ye
作者机构：
关键词： 中胚轴;混合分组分析法;Δ(SNP-index);连锁分析;候选基因
期刊名称： 作物学报
ISSN： 0496-3490
年卷期： 2021 年 47 卷 010 期
页码： 2036-2044
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 中胚轴长度(mesocotyl length,ML)是影响旱直播水稻出苗和早期幼苗活力的重要性状.发掘中胚轴伸长相关位点,解析其遗传机制,选育长中胚轴品种是促进旱直播技术推广最为经济和有效的方式.本研究以长中胚轴品种'Changai'和短中胚轴品种'IR 145'为亲本构建的F2遗传分离群体为材料,构建长池和短池并开展深度重测序(50×).利用Δ(SNP-index)和G-value两种方法在3号染色体29.56~33.28 Mb处鉴定到1个中胚轴伸长相关位点qML3.在候选区域开发KASP标记,对184个F2株系开展连锁分析,将候选区间缩小到28.89~31.03 Mb.结合基因注释、连锁分析和基因表达分析结果,推测LOC_Os03g52450、LOC_Os03g56060、LOC_Os03g58290、LOC_Os03g58300、LOC_Os03g58320、LOC_Os03g56050和LOC_Os03g57640为候选基因.这些基因分别与植物激素的调控和细胞分裂相关机制有关.本研究发掘了一个水稻中胚轴伸长相关位点,对选育长中胚轴品种有一定帮助.
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