乌头驴与三粉驴骨骼肌中miRNAs的表达鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马程

作者： 马程;胡文萍;石田培;侯浩宾;李海静;张新浩;杨莉;张莉

作者机构：

关键词： 德州驴;骨骼肌发育;转录组;miRNA

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 1894-1905

收录情况： 北大核心

摘要： 试验旨在分析microRNAs（miRNAs）在德州驴骨骼肌中的表达情况,探讨小RNA（small RNA）在驴骨骼肌发育中的调控机制。采集德州驴2个品系（乌头驴和三粉驴）的背最长肌组织,构建乌头驴背最长肌（WB）和三粉驴背最长肌（SB）的small RNA测序文库并进行测序,运用生物信息学技术对WB和SB之间差异表达的miRNAs进行分析,预测和解析可能影响驴产肉性状的miRNAs,从中挑选了6个表达量较高的miRNAs,利用实时荧光定量PCR技术来验证测序结果的准确性。结果表明,在WB和SB文库中分别鉴定出保守miRNAs有982和1 149个,新miRNAs有106和143个。在WB与SB比较组中基于条件|log2（foldchange）|≥2、P≤0.05获得17个差异表达的miRNAs,其中表达量上调的有5个,下调的有12个。通过GO注释,发现差异表达的miRNAs显著富集于调控细胞迁移分化、细胞分裂和骨骼肌细胞收缩等生物学过程（P<0.05）,并且挖掘到与驴骨骼肌发育相关的bta-miR-378dL+1R-11ss22CA、bta-miR-378dR-2,其靶向NPY1R、GPR152、BEST1、KCNH8、SPAG9等多个基因。KEGG富集结果表明,miRNAs富集于Wnt、MAPK、泛素蛋白水解系统等与骨骼肌发育相关的信号通路中,其中在Wnt信号通路中共涉及到17个差异表达miRNAs的207个靶基因,尤其以PC-5p-8448331、hsa-miR-186-3pR-3和cfa-miR-329b1ss19CT的靶基因最多。实时荧光定量PCR结果与miRNAs测序结果一致,并发现除eca-miR-181b外,其他5个miRNAs在SB中的表达水平均高于WB。本研究首次对驴骨骼肌miRNAs进行转录组学分析,揭示了乌头驴和三粉驴miRNAs的表达差异,研究结果为阐明德州驴骨骼肌生长发育的分子调控机制提供参考。

分类号： S822

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