富营养饮食重塑代谢性疾病易感猪关键组织mRNA剪接模式研究
文献类型: 中文期刊
第一作者: 夏博策
作者: 夏博策;张凯艺;苗佳坤;彭焕祺;杨宇;陶聪;吴添文;王彦芳;杨述林
作者机构:
关键词: 富营养饮食;代谢性脂肪肝病;代谢性疾病易感猪;可变剪接;剪接因子
期刊名称: 畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2022 年 008 期
页码: 2537-2547
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 旨在探讨富营养饮食对代谢性疾病易感猪关键组织可变剪接(alternative splicing, AS)和剪接因子(splicing factors, SFs)的影响。本研究以健康状态、月龄和体重相同的12头代谢性疾病易感公猪为材料,随机将其分为两组,其中8头猪饲喂高脂高能量饲料2个月作为富营养饮食组(TG-HFHSD),4头猪饲喂正常饲料2个月作为对照饮食组(TG-CD)。对TG-HFHSD和TG-CD的脂肪、肝、肌肉和下丘脑组织进行RNA-seq测序,利用rMATS软件鉴定组间差异AS,对差异剪接基因(differential splicing genes, DSGs)进行GO和KEGG富集分析,并利用DESeq2软件和皮尔逊相关性系数分析肝组织中的SFs。结果显示,脂肪、肝、肌肉和下丘脑中分别鉴定到48 279、 39 536、47 888和52 210个AS事件,均以SE类型为主,占比在77.09%~78.29%之间。脂肪、肝、肌肉和下丘脑中的DSGs数分别为528、1 070、570和600个,其中肝增加的DSGs部分主要是RI和MXE两种类型,分别为177和471个,而其它组织仅为12~28个和99~110个。GO和KEGG富集显示,肝DSGs除富集到细胞结构相关的过程外,还显著富集到可变剪接及mRNA代谢、脂质代谢、DNA损伤及修复、补体与凝血级联等过程。肝中筛选到56个差异表达的SFs,其中CLK1、PGC-1ɑ、USP4等与糖脂代谢和代谢性疾病密切相关。本研究表明,富营养饮食显著增加了肝DSGs,通过剪接调控、糖脂代谢以及DNA损伤来影响肝代谢性疾病的发生,将为肝代谢性疾病早期发生机制研究提供参考。
分类号: S858.28
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