基于基因组重测序的长江上游瓦氏黄颡鱼群体遗传结构

文献类型： 中文期刊

第一作者： 熊飞

作者： 熊飞;刘红艳;翟东东;段辛斌;田辉伍;陈大庆

作者机构：

关键词： 瓦氏黄颡鱼;长江上游;遗传分化;遗传多样性;基因组重测序

期刊名称： 生物多样性

ISSN： 1005-0094

年卷期： 2023 年 004 期

页码： 142-151

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用基因组重测序的方法获取高通量SNP标记,分析了长江上游三峡大坝-白鹤滩大坝之间8个不同江段（太平溪、巴南、合川、岷江口、宜宾、邵女坪、桧溪、冯家坪）共136尾瓦氏黄颡鱼（Pelteobagrus vachelli）的遗传多样性和遗传分化水平,阐明了长江上游瓦氏黄颡鱼群体遗传结构。结果显示:（1）三峡库区太平溪群体和巴南群体具有较高的SNP（singlenucleotide polymorphism）数量和核苷酸多样性指数,遗传来源丰富,其遗传多样性高于其他群体;上游的岷江口、宜宾、邵女坪和冯家坪群体遗传来源单一。（2）瓦氏黄颡鱼存在3个不同的遗传分支,且不同遗传分支之间存在较大的遗传分化。（3）群体SNP数量和核苷酸多样性指数与河流坡降呈显著负相关,群体遗传分化指数与地理距离和隔离时间无显著相关性。研究结果表明,在三峡大坝-白鹤滩大坝江段,瓦氏黄颡鱼上游群体具有更低的遗传多样性,更易发生遗传漂变作用,在鱼类遗传多样性保护中需要特别关注;瓦氏黄颡鱼存在3种显著的遗传结构,应视为3个不同遗传单元进行种质资源管理。

分类号： S917.4

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