微型反向重复转座元件(MITE)靶区域扩增多态性:一种基于MITE的分子标记方法在水稻及其他植物上的应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 马忠友

作者： 马忠友;苏京平;孙林静;刘学军;王春敏;王胜军;曾斌;梁永书;闫双勇

作者机构：

关键词： 微型反向重复转座元件;靶区域扩增多态性;分子标记;引物设计;水稻;棉花;番茄;拟南芥

期刊名称： 中国水稻科学

ISSN： 1001-7216

年卷期： 2007 年 21 卷 05 期

页码： 459-463

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用根据水稻微型反向重复转座元件(miniature inverted repeat transposable element,MITE)序列设计的特异引物,以及靶区域扩增多态性(target region amplification polymorphism,TRAP)方法中的随机引物及扩增程序对不同的水稻材料进行PCR扩增来检测MITE侧翼为基因区域的多态性,称之为微型反向重复转座元件靶区域扩增多态性(MITE-TRAP)。每次扩增能产生1条或多条清晰条带,条带的大小为100~1500 bp,可在1.5%的琼脂糖凝胶上分离,有较好的可重复性,并发现了不同水稻品种间的多态性条带。进一步用基于水稻预测的MITE序列设计的特异引物对来自棉花、番茄及拟南芥的DNA样品进行MITE-TRAP扩增,均能成功扩增出条带,显示这种方法可以直接在其他植物中应用。还进一步讨论了该方法的优点及其可能的应用。

分类号： S511

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