辣椒TPS家族成员的鉴定与CaTPS1的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 魏兵强

作者： 魏兵强;王兰兰;张茹;陈灵芝;张少丽;张建农

作者机构：

关键词： 辣椒;海藻糖–6–磷酸合成酶基因;全基因组鉴定;基因表达

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2016 年 43 卷 08 期

页码： 1504-1512

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用生物信息学方法,从辣椒全基因组数据库中共鉴定出11个辣椒TPS基因,除Ca TPS3含有1个TPS和2个TPP结构域外,其余分别含有1个TPS和1个TPP结构域。11个Ca TPS分为2类,ClassⅠ包含3个基因(Ca TPS1~Ca TPS3),分别含有16、16和13个内含子,Ca TPS1和Ca TPS2含Motif 1~Motif 5各1个,而Ca TPS3含有2个Motif 4和1个Motif 3。ClassⅡ包含8个基因(Ca TPS4~Ca TPS11),均含有2个内含子,且分别含Motif 1~Motif 6各1个。利用荧光定量PCR对Ca TPS1在辣椒组织表达的特异性和低温应答模式进行分析,结果表明:Ca TPS1在叶片中的表达量大约是根和茎中的5~6倍,说明Ca TPS1的表达具有明显的组织特异性;低温处理后Ca TPS1在根和茎中的表达高峰出现时间明显早于叶片,说明不同组织中Ca TPS1对低温胁迫的应答时间存在一定差异。

分类号： S641.3

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