miR-127-3p对C2C12细胞成肌分化和转录组的影响

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋天增

作者： 宋天增;李杰;马金英;蒋婧;王高富;付琳;周鹏;马友记;任航行

作者机构：

关键词： RNA-Seq;microRNA;过表达;C2C12;成肌分化

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2019 年 01 期

页码： 8-16

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 前期研究表明,miR-127-3p参与骨骼肌细胞分化的调控,但对于miR-127-3p调控的靶基因及其在成肌分化中的作用还不清楚。应用qRT-PCR与细胞形态学方法研究过表达miR-127-3p对C2C12成肌细胞分化及成肌标志基因MyoD、MyoG和Myosin表达的影响;RNA-Seq分析过表达miR-127-3p对成肌细胞转录组的影响,鉴定差异表达基因并对其功能进行初步研究。结果表明,过表达miR-127-3p显著促进C2C12细胞的成肌分化与MyoD、MyoG和Myosin表达;RNA-Seq分析共鉴定到3个差异基因,均为下调基因,其中包括2个转录因子(Irf7和Ddit3)。GO与KEGG分析显示,这些差异基因显著富集于免疫和能量代谢过程/信号通路。生物信息学分析发现,miR-127-3p可与Ddit3基因的CDS区发生碱基互补配对,进而抑制其表达。表明在转录组水平上,miR-127-3p可能通过直接靶向Ddit3基因/转录因子调控免疫与能量代谢类基因的表达,进而调节成肌细胞分化。

分类号： Q75

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