绵羊GDF9基因mRNA、DNA和调控区序列克隆及其在11个品种中遗传多态性检测

文献类型: 中文期刊

第一作者: 潘章源

作者: 潘章源;贺小云;刘秋月;胡文萍;王翔宇;郭晓飞;曹晓涵;狄冉;储明星

作者机构:

关键词: 绵羊;GDF9基因;mRNA;调控区;遗传多态性

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2016 年 47 卷 08 期

页码: 1555-1564

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究旨在克隆绵羊生长分化因子9(Growth differentiation factor 9,GDF9)基因mRNA、DNA和调控区全序列,并检测其在11个绵羊品种中的遗传多态性,探究GDF9基因与绵羊多羔性状的关系。首先应用RACE和PCR技术克隆GDF9基因全长序列,其次利用SNaPshot分型技术检测11个绵羊品种GDF9基因遗传多态性。结果显示,克隆获得GDF9基因mRNA全长1 852bp(GenBank序列号:KR063137),编码区两侧翼分别具有5′-UTR58bp(1~58nt)和3′-UTR 432bp(1 421~1 852nt)。进一步克隆获得长为2 898bp的DNA序列和2 304bp的调控区序列,分析发现调控区序列比数据库序列(NC_019462.1)多两个长片段。序列比对发现了已知突变G260A(G1)和调控区新突变-2078C>G。分型结果显示,11个绵羊品种均不含FecGE、FecGH、FecGT、FecGF、FecGV突变,而G260A和-2078C>G广泛存在于除草原型藏羊外的各绵羊品种中,G260A表现3种基因型(AA、BB和AB),首次在小尾寒羊和山谷型藏羊中检测到BB型突变纯合子。-2078C>G也存在3种基因型,基因型结果表明该位点与G260A完全连锁。关联分析结果显示,小尾寒羊AB型产羔数显著高于AA型(P<0.05)。本研究完善了绵羊GDF9mRNA、DNA和调控区全长序列,为进一步研究GDF9基因功能奠定了基础。同时在不同绵羊品种中发现了G260A和-2078C>G突变,其中G260A作为潜在的有效遗传标记可用于提高绵羊的产羔数。

分类号: S826

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