基于微卫星标记对6个花鲈群体的遗传多样性分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 黄皓
作者: 黄皓;范嗣刚;王鹏飞;陈佳;赵超;闫路路;邱丽华;潘滢
作者机构: 上海海洋大学水产与生命学院;中国水产科学研究院南海水产研究所/广东省渔业生态环境重点实验室;宁德市富发水产有限公司/大黄鱼育种国家重点实验室
关键词: 花鲈;微卫星;遗传多样性;遗传分化
期刊名称: 南方水产科学
ISSN: 2095-0780
年卷期: 2022 年 18 卷 001 期
页码: 99-106
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了解中国不同地理群体花鲈(Lateolabrax maculatus)的遗传结构,从花鲈基因组序列中筛选出11个具有多态性的微卫星位点,对中国沿海地区(天津、长岛、青岛、上海、厦门和北海)6个花鲈野生群体的遗传多样性进行分析.11个微卫星位点共检测到57个等位基因,7个微卫星位点具有高度多态性.6个群体的等位基因数(Na)为3.9091~4.6364,有效等位基因数(Ne)为2.2934~2.7735,观测杂合度(Ho)为0.3913~0.4568,期望杂合度(He)为0.5051~0.5662,多态信息含量(PIC)为0.3888~0.5189.青岛、上海和北海群体具有高度多态性,其余群体为中度多态性.上海群体的遗传多样性最高,长岛群体和厦门群体的遗传多样性低.6个群体间的遗传分化指数(FST)为0.0226~0.0552,其中天津群体和北海群体间的遗传分化最大,群体间的遗传分化程度低.基因流(Nm)为4.2766~11.2208,6个群体间的基因交流频繁;分子方差分析(AMOVA)显示群体内变异占总变异的91%,群体间变异占9%.基于个体归类的聚类分析显示6个群体的花鲈个体均被划分到2个基因型类群中,无独立的基因型类群.UPMGA聚类树显示6个群体分为两支.
分类号: S917.4
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