萝卜TALE转录因子家族的鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 赵伟

作者： 赵伟;李锡香;王海平;贾会霞;宋江萍;阳文龙;张晓辉

作者机构：

关键词： 萝卜;TALE基因家族;基因结构;进化分析;组织表达

期刊名称： 生物工程学报

ISSN： 1000-3061

年卷期： 2022 年 01 期

页码： 343-358

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： TALE (three-amino acid loop extension)转录因子在植物生长发育及细胞分化过程中起重要作用。在多种植物中均已鉴定出TALE转录因子的家族成员,但是萝卜TALE转录因子家族的研究鲜有报道。文中通过生物信息学手段在象牙白萝卜全基因组中鉴定出了分布于9条染色体上的33个TALE家族基因。研究结果显示,该家族中除与拟南芥KNATM同源的基因Rsa10037940外,其余基因均含有编码HOX保守结构域的序列。这些基因含有4–6个外显子。萝卜的33个TALE基因与拟南芥中的17个同源基因存在共线性关系。33个TALE基因启动子区的顺式元件中包含大量逆境响应元件。表达特性分析显示,该基因家族BELL亚家族内有4个基因在根内表达量较高,KNOX亚家族内有2个基因在薹和愈伤中表达量较高。该家族不同亚型成员之间的蛋白3D结构高度相似。编码蛋白均为弱酸、有亲水性。萝卜TALE基因家族在进化上较为保守,分化上与拟南芥存在一致性,与水稻差异较大。本研究为开展萝卜中TALE转录因子的生物学功能研究提供了重要参考。

分类号： S631.1

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