枸杞SWEET基因家族鉴定及其与可溶性糖含量关系
文献类型: 中文期刊
第一作者: 尹跃
作者: 尹跃;秦小雅;赵建华;杨萍;何军;安巍
作者机构:
关键词: 枸杞;SWEET基因家族;进化分析;表达分析;可溶性糖含量
期刊名称: 西北植物学报
ISSN: 1000-4025
年卷期: 2024 年 44 卷 003 期
页码: 396-407
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]糖外排转运蛋白(sugars will eventually be exported transporters,SWEETs)在植物生长发育过程中发挥重要作用,解析SWEETs基因在枸杞果实发育过程中对糖积累作用,为进一步揭示SWEETs基因在枸杞果实发育过程中的作用提供参考.[方法]用生物信息学方法对枸杞SWEET基因(LbaSWEETs)进行全基因组鉴定,并用已发表的转录数据分析LbaSWEETs在果实发育时期的基因表达情况.[结果]枸杞SWEET基因家族共有37个成员,随机分布于10条染色体上,分别编码152~621个氨基酸,蛋白质分子质量为16.87~69.97 kD,等电点为4.96~9.86.亚细胞定位预测位于叶绿体或质膜,大多数含有7个跨膜螺旋.系统进化分析发现,37个LbaSWEETs蛋白可分为4个亚群,每个亚群的基因结构和保守基序组成相似.启动子元件分析表明:Lba-SWEETs基因启动子富含大量激素响应、逆境胁迫和生长发育响应元件.转录组数据和qRT-PCR分析表明:LbaSWEET9和LbaSWEET29基因表达量随果实成熟呈现显著增加.相关性分析结果表明,LbaSWEET9和LbaSWEET29基因表达量与果糖含量呈显著正相关.[结论]LbaSWEET9和LbaSWEET29基因是果糖积累的关键基因.
分类号: Q943.2%Q781
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