山羊SKIP基因的分离、鉴定及与生长性状的关联分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 熊琪

作者： 熊琪;张年;李小姗;李晓锋;索效军;杨前平;陶虎;陈明新

作者机构：

关键词： 单核苷酸多态性位点;山羊;骨骼肌和肾脏富集的肌醇磷酸酶;生长性状;成肌分化

期刊名称： 华中农业大学学报

ISSN： 1000-2421

年卷期： 2017 年 36 卷 06 期

页码： 83-88

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究SKIP基因对山羊生长发育的影响,并寻找与山羊生长性状相关的分子标记,利用绵羊与牛SKIP基因的同源序列设计引物,RT-PCR扩增得到一段长1 350bp的山羊SKIP基因表达序列,包括其完整编码区序列,编码449个氨基酸的蛋白。通过序列Blast比较和系统发育树的构建,发现山羊SKIP与绵羊SKIP序列相似性最高(99.52%)。利用生物信息学分析SKIP蛋白的理化性质,预测SKIP蛋白分子质量为52ku,等电点为5.18,包含典型的疏水区域和磷脂酰肌醇5-磷酸磷酸酶结构域,定位在细胞质(60.9%)和细胞核(26.1%)中。间接免疫荧光试验验证了SKIP的细胞定位,并发现位于细胞核中的SKIP在成肌细胞分化过程中转移到细胞质。通过波尔山羊和麻城黑山羊的DNA混池测序,发现SKIP内含子2有一处G/A突变,利用PCRRFLP方法对波尔×麻城黑山羊F2代杂交后代进行基因分型,性状关联分析发现该单核苷酸多态性位点(SNP)与出生体质量、胸围、管围、身高等性状显著相关,等位基因G与生长呈正相关。

分类号： S827

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