普通烟草ARF基因家族序列的鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙亭亭

作者： 孙亭亭;张磊;陈乐;龚达平;王大伟;陈雅琼;陈蕾;孙玉合

作者机构：

关键词： 普通烟草;ARF基因家族;系统进化;基因表达

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2016 年 17 卷 01 期

页码： 162-168

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： ARF(AUXIN RESPONSE FACTOR)基因含有一个B3功能域和具有转录激活或抑制活性的中心功能域,在植物发育过程中起到非常重要的作用。本研究采用生物信息学方法,根据拟南芥ARF基因序列鉴定了普通烟草基因组中的ARF基因,并对家族成员进行了序列特征、系统发生、亚细胞定位和表达模式分析。目前在普通烟草基因组中共得到50个ARF基因成员,其基因结构相对复杂,一般含有10个外显子。亚细胞定位结果表明,少数ARF蛋白定位到线粒体或叶绿体,大多数未检测到定位信号。转录组数据分析表明,ARF基因具有不同的组织表达模式,部分基因表现出组织特异性。这些研究结果为普通烟草ARF基因家族功能的深入研究奠定了基础。

分类号： S572

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