三疣梭子蟹多态性微卫星DNA标记的筛选及评价

文献类型: 中文期刊

第一作者: 韩智科

作者: 韩智科;刘萍;李健;高保全;陈萍

作者机构:

关键词: 三疣梭子蟹;微卫星标记;多态性;遗传多样性

期刊名称: 渔业科学进展

ISSN: 1000-7075

年卷期: 2012 年 33 卷 01 期

页码: 74-80

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据前人FIASCO方法构建的三疣梭子蟹微卫星富集文库,对含微卫星的DNA序列设计了71对引物并对其进行了多态性筛选,筛选出21对多态的微卫星引物,对三疣梭子蟹1个野生群体的30个个体进行遗传多样性检测,同时对引物进行评价。21个位点共获得了188个等位基因,平均每个位点扩增得到8.9个等位基因。不同引物获得的等位基因数差异较大,从3~13个不等,其中Pot8、Pot37、Pot48、Pot53、Pot54、Pot66六个位点分别获得了11、12、12、11、13、11个等位基因,而Pot46仅获得了3个等位基因。等位基因的大小分布在131~312bp,基本符合引物设计时理论产物长度。21个微卫星位点的期望杂合度的范围为0.659~0.889,PIC值均高于0.5,表明它们都有很高的杂合度,均可用于三疣梭子蟹种群遗传结构分析,为三疣梭子蟹品种选育、种系评估提供更多的微卫星DNA信息。

分类号: S917.4

  • 相关文献

[1]三疣梭子蟹微卫星富集文库的构建与群体遗传分析. 李晓萍,刘萍,宋协法. 2011

[2]济宁青山羊微卫星标记多态性分析. 王可,刘昭华,崔绪奎,楚惠民,张玉玉,韩红. 2017

[3]大黄鱼群体遗传多样性的微卫星DNA分析. 林能锋,苏永全,丁少雄,王军. 2012

[4]三疣梭子蟹Ⅰ型微卫星标记的发掘及多态性分析. 吕建建,王渝,高保全,李健,刘萍. 2013

[5]微卫星DNA标记用于三疣梭子蟹家系亲子关系的鉴定. 刘磊,李健,刘萍,高保全,陈萍,戴芳钰,王学忠. 2010

[6]三疣梭子蟹微卫星标记与生长相关性状的相关性分析. 刘磊,李健,刘萍,赵法箴,高保全,杜盈,马春艳. 2012

[7]三疣梭子蟹野生群体同工酶的遗传多态性分析. 高保全,刘萍,李健,戴芳钰. 2007

[8]肉用绵羊2号染色体GDF8区域4种微卫星标记多态性研究. 宋彦红,石国庆,柳楠,代蓉,任航行,刘国庆. 2007

[9]基于高通量测序的青石斑鱼基因组微卫星开发及评价. 高峰涛,邵长伟,崔忠凯,王升鹏,魏敏,陈松林,杨官品. 2017

[10]早胜牛微卫星多态性及其与生长性状的关联分析. 迟浩斌,韩向敏,郎侠,王彩莲. 2019

[11]火龙果转录组SSR的信息分析及其分子标记开发. 王壮,郑乾明,成文韬,毛永亚,蔡永强,马玉华. 2018

[12]小尾寒羊微卫星标记的多态性及其与繁殖性能的相关性研究. 刘永祥,刘艳丽,朱宽佑,杜立新. 2008

[13]草鱼三、四核苷酸重复微卫星标记的分离与特征分析. 李文升,刘翠,鲁翠云,李超,孙效文. 2011

[14]微卫星位点在Q型烟粉虱入侵种群中的多态性分析. 刘国霞,褚栋. 2011

[15]利用SSR标记鉴定家蚕不同系统的品种初探. 郭秋红,李木旺,李明辉,司科,苗雪霞,徐安英,黄勇平. 2005

[16]粳稻近缘品种的SSR分析. 鲍根良,小林麻子,富田桂,金庆生,张小明,严文潮,叶胜海. 2005

[17]应用SSR分析5个三疣梭子蟹野生群体的遗传多样性. 李晓萍,刘萍,李健,高保全. 2011

[18]利用16S rRNA和COI基因序列对三疣梭子蟹不同群体遗传特征的比较分析. 高俊娜,刘萍,李健,潘鲁青,高保全,陈萍. 2010

[19]三疣梭子蟹选育家系微卫星分析. 韩智科,刘萍,李健,高保全,陈萍. 2012

[20]基于线粒体D-loop基因的中国海三疣梭子蟹遗传多样性与遗传分化研究. 董志国,李晓英,王普力,王文进,张庆起,阎斌伦,孙效文. 2013

作者其他论文 更多>>