双孢蘑菇不同潮次采收期转录组差异表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 郭姿儿

作者： 郭姿儿;冯伟林;金群力;宋婷婷;沈颖越;王梅;张军;范丽军;赵睿萌;蔡为明

作者机构：

关键词： 双孢蘑菇;转录组测序;过氧化氢酶;酪氨酸酶

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2024 年 55 卷 012 期

页码： 3533-3543

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】分析双孢蘑菇不同潮次采收期转录组差异表达，为筛选影响双孢蘑菇产量和品质的关键基因及双孢蘑菇的高效栽培提供理论参考。【方法】以双孢蘑菇A15为试验材料，利用转录组测序（RNA-Seq）技术对双孢蘑菇第1潮次采收期（CZ1）、第2潮次采收期（CZ2）、第3潮次采收期（CZ3）样品进行分析。将RNA-Seq数据序列比对参考基因组筛选差异表达基因，对差异表达基因进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析，并通过实时荧光定量PCR验证RNA-Seq结果的准确性。【结果】不同潮次样品共获得58.54Gb的Cleandata,Q20为98.41%～98.49%,Q30为95.01%～95.24%，有效碱基占比为49.00%～49.70%。以CZ1样品为对照组，在CZ2和CZ3样品中分别筛选到849和1297个差异表达基因，CZ1 vs CZ2组和CZ1 vs CZ3组中共有545个差异表达基因，CZ1 vs CZ2组、CZ1 vs CZ3组和CZ2vsCZ3组中共有90个差异表达基因。差异表达基因GO功能注释分析结果显示，CZ1vsCZ2组、CZ1vsCZ3组中差异表达基因被注释到的GO功能分为生物过程、分子功能和细胞组分三大功能类别。KEGG信号通路分析结果显示，CZ1vsCZ2组和CZ1vsCZ3组中代谢途径、抗生素的生物合成以及次生代谢产物的合成等信号通路被显著富集。从高表达量的差异表达基因中筛选出10个差异表达基因进行分析，CZ3样品中酪氨酸酶基因（TYR）表达量是CZ1样品的7.04倍，CZ1样品中过氧化氢酶基因（CAT3）表达量达到峰值，为CZ3样品的3.20倍。4个差异表达基因的表达趋势与RNA-Seq分析结果基本一致。【结论】从3个不同潮次采收期A15双孢蘑菇样品差异表达基因中筛选到10个高表达量基因，其中包括催化黑色素生成的关键限速酶基因TYR及过氧化氢酶的编码基因CAT3。不同潮次采收期双孢蘑菇的抗氧化能力不同，第1潮次采收期双孢蘑菇的抗氧化能力最强，而第3潮次采收期的抗氧化能力最弱。

分类号： S646.11

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