肠舌状绦虫线粒体基因组特征及系统发育分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈秀琴

作者： 陈秀琴;邱阳元;吕庆博;黄梅清

作者机构：

关键词： 肠舌状绦虫;线粒体基因组;结构特征;系统发育

期刊名称： 畜牧兽医学报

ISSN： 0366-6964

年卷期： 2024 年 55 卷 012 期

页码： 5725-5737

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究旨在获得肠舌状绦虫线粒体基因组全序列，了解其序列的结构特征，探究肠舌状绦虫系统发育相关信息。从麦穗鱼中获得肠舌状绦虫，提取基因组DNA,通过Illumina测序技术对肠舌状绦虫的线粒体全基因组进行测序、组装和注释，并进行生物信息学分析；从GenBank数据库中下载8个科34种绦虫的线粒体基因组序列，运用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树。结果显示，肠舌状绦虫线粒体基因组全长为13 655 bp, A+T含量为67.6%,其碱基组成具有明显的AT偏向性。肠舌状绦虫线粒体基因组包括12个蛋白编码基因(protein-coding genes, PCGs)、22个tRNA基因、2个rRNA基因和2个非编码控制区。在12个PCGs中，除cox3基因使用TTG作为起始密码子外，其余11个PCGs均使用ATG作为起始密码子；终止密码子方面，5个PCGs使用TAA,5个PCGs使用TAG,而cox3基因和nad3基因均没有终止密码子。PCGs使用密码子频率最高的是UUA,最低的是CGA。22个tRNA基因总长为1 272 bp,大多数tRNA能形成典型的三叶草结构，但是trnS1和trnR由于缺少二氢尿嘧啶臂无法形成典型的三叶草结构。nad2、nad6和nad4基因更适合作为肠舌状绦虫的分子标记。系统发育树结果表明，肠舌状绦虫与双线绦虫亲缘关系最近，并与双槽头属绦虫(Dibothriocephalus)形成姐妹群。本研究获得了肠舌状绦虫的线粒体全基因组，为研究肠舌状绦虫的分类学和系统学提供参考。

分类号： S852.734

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