藜麦BADH基因家族鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈翠萍

作者： 陈翠萍

作者机构：

关键词： 藜麦;BADH;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 21 卷 019 期

页码： 6276-6284

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 耐盐性是藜麦重要的优良特征之一,甜菜碱醛脱氢酶(BADH)基因是参与藜麦耐盐胁迫途径的关键酶.然而,关于藜麦BADH基因家族的研究却很少.本研究基于藜麦基因组数据库,进行藜麦BADH基因家族筛选及生物信息学分析.结果表明,藜麦共筛选到3个BADH基因成员,BADH蛋白氨基酸长度分别为500 aa和501 aa,蛋白分子量为54.47~54.80kD,理论等电点为5.26~5.44,呈酸性,蛋白性质稳定,为疏水性蛋白;预测BADH蛋白亚细胞定位于叶绿体、线粒体和过氧物酶体,且无跨膜结构域,均属于ALDH-SF su-per family(醛脱氢酶超家族);基因结构分析表明,藜麦BADH基因家族均含有15个外显子和14个内含子,基因结构相似;系统进化分析表明,藜麦BADH与中亚滨藜、菠菜和籽粒苋同属一分支;启动子顺式作用元件分析显示,BADH基因启动子含有多个与光响应、植物激素、胁迫和植物生长相关的顺式作用元件.本研究通过生物信息学对藜麦BADH基因家族进行分析,为进一步研究BADH基因功能提供参考.

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