大肠杆菌ERIC-PCR分子分型方法的建立及其初步应用

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张辉

作者： 张辉;杨振泉;赵隽;魏瑞成;王冉

作者机构：

关键词： 大肠杆菌;ERIC-PCR;分子分型

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2010 年 26 卷 05 期

页码： 1098-1103

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为建立高效、敏感的肠杆菌科基因间重复一致序列PCR(ERIC-PCR)的分子分型方法,该研究提取大肠杆菌基因组DNA,以此为模板建立和优化ERIC-PCR分型体系,并采用ERIC-PCR方法对62株大肠杆菌进行分子分型和遗传相似性统计分析。结果显示从提取的大肠杆菌基因组中能够扩增到2~8条DNA片段,且大部分片段在100 bp至2 000 bp之间。通过4因素3水平正交试验,建立了较为稳定的ERIC-PCR分型方法。利用ERIC-PCR方法可将62株菌分为20型,其中以A型为优势菌群。遗传相似性结果表明,各菌株之间遗传相似性有较大的变化,但部分菌株高度同源。聚类分析表明,ERIC-PCR的分辨率系数为0.937,具有较高的分辨能力。表明应用ERIC-PCR分型技术在分子水平上对大肠杆菌进行鉴别和分型,具有简便和分辨力高等优点,能够对病原进行溯源分析,在大肠杆菌的分子流行病学研究中具有广泛的应用前景。

分类号： Q78

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