安徽白山羊GDF9基因群体遗传效应分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 汤继顺
作者: 汤继顺;章薇;朱德建;惠文巧;苏世广;陈胜
作者机构:
关键词: 安徽白山羊;GDF9基因;产羔数;PCR-SSCP
期刊名称: 中国草食动物科学
ISSN: 2095-3887
年卷期: 2016 年 36 卷 06 期
页码: 1-5+74
摘要: 为验证GDF9基因是否与山羊产羔数存在关联性,采集具有1~5胎产羔记录的安徽白山羊经产母羊血样265份,提取血液总DNA;根据基因序列(Gen Bank:EF446168.2)和参考文献设计4对引物,利用PCR-SSCP方法检测GDF9基因2个外显子在安徽白山羊品种中是否存在遗传多态性,采用最小二乘均值法分析遗传突变位点不同基因型产羔数之间的差异。结果表明:在外显子1中存在1个SNP EF446168.2:c.1956A>C(同义突变),而在外显子2中存在2个SNPs(EF446168.2:c.3319G>A,错义突变;EF446168.2:c.4085G>A,同义突变)。群体遗传分析发现,3个SNP位点均存在3种基因型,优势基因型频率分别为AA(0.607 5)、GG(0.750 9)、GG(0.786 8)。关联性分析表明,在EF446168.2:c.1956A>C位点,3种基因型安徽白山羊产羔数LSM(最小二乘均值)无显著差异;对EF446168.2:c.3319G>A位点,AA型产羔数LSM分别比GG型个体和GA型个体LSM高0.77只和0.41只(P<0.01);对EF446168.2:c.4085G>A,AA型个体产羔数LSM分别比GG型个体和GA型个体LSM高0.43只和0.28只(P<0.01)。因此,GDF9基因与安徽白山羊产羔数密切相关,可能是影响产羔数的一个主效基因;EF446168.2:c.1956A>C、EF446168.2:c.3319G>A、EF446168.2:c.4085G>A可能作为分子标记,应用于安徽白山羊多胎性育种。
分类号: S827
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