森林草莓精氨酸脱羧酶基因的电子克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王静

作者： 王静;赵密珍;王壮伟;吴伟民;钱亚明

作者机构：

关键词： 森林草莓;ADC基因;电子克隆;生物信息学;RT-PCR

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2011 年 27 卷 03 期

页码： 173-178

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从森林草莓中分离精氨酸脱羧酶基因(FvADC),分析其表达模式、序列特征和进化关系。采用电子克隆结合RT-PCR分离FvADC;半定量RT-PCR检测其在盐、热、冷胁迫下的表达情况;生物信息学分析FvADC的结构与进化。结果获得FvADCcDNA全长,包括2 154 bp的编码区,RT-PCR验证编码区序列与电子克隆序列一致;FvADC基因编码的精氨酸脱羧酶与桃、苹果和海棠的同源性分别达87%、84%和83%,含信号肽,具有2个保守的氨基酸结构域:ADC家族2磷酸吡哆醛结合位点和ADC家族2标记2序列;进化分析表明森林草莓精氨酸脱羧酶与苹果、桃精氨酸脱羧酶关系最近;半定量RT-PCR证实FvADC在盐、热、冷胁迫下诱导表达。以上结果说明电子克隆能用于草莓基因的分离,而FvADC可作为逆境候选基因用于草莓遗传改良。

分类号： Q943.2`S668.4

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