基于Smart-seq2技术探究玻璃化冷冻对牛活检囊胚基因表达的影响
文献类型: 中文期刊
第一作者: 董建华
作者: 董建华;杨柏高;张笑梦;冯肖艺;赵学明;吕丽华
作者机构:
关键词: Smart-seq2技术;牛囊胚;玻璃化冷冻;胚胎活检;转录组测序
期刊名称: 浙江大学学报(农业与生命科学版)
ISSN: 1008-9209
年卷期: 2025 年 51 卷 005 期
页码: 754-766
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为探究胚胎活检及后续玻璃化冷冻处理对牛体外受精囊胚基因表达的影响,以牛体外囊胚为研究对象,设置新鲜组(未经任何体外操作的原始胚胎)、活检组(经滋养外胚层活检的胚胎)、活检后玻璃化冷冻组(活检后的胚胎经玻璃化冷冻保存),每组选取3枚形态良好的囊胚,利用Smart-seq2单细胞全长转录组测序技术进行转录组分析,并在基因本体(gene ontology, GO)数据库及京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)中进行富集分析。结果表明:与新鲜组相比,在活检组中共鉴定到1 083个差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs),GO和KEGG富集分析显示,这些DEGs与细胞脂质代谢过程、葡萄糖稳态、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路等相关;相较于新鲜组,在活检后玻璃化冷冻组中共鉴定到1 391个DEGs,主要富集于糖异生、全局代谢通路及氨基酸合成等生物学过程;与活检组相比,在活检后玻璃化冷冻组中共鉴定到824个DEGs,主要与丙酮酸代谢、N-聚糖生物合成、细胞衰老等相关。综上所述,本研究基于Smart-seq2单细胞全长转录组测序技术揭示了玻璃化冷冻对活检后牛体外囊胚脂质代谢、能量代谢、MAPK信号通路等相关基因表达的影响,为优化牛胚胎冷冻保存技术、提升良种胚胎利用率提供了分子靶点与理论依据。
分类号: S823
- 相关文献
[1]猪胚胎开放式拉长细管玻璃化冷冻保存研究. 张德福,刘东,吴华丽,郑筱峰,王昭凯,王少兵. 2006
[2]猪胚胎的OPS玻璃化冷冻. 张德福,刘东,吴华丽,郑筱峰,王昭凯,王少兵. 2007
[3]玻璃化快速冷冻仪在猪MⅡ期卵母细胞玻璃化冷冻中的应用. 徐利,戴建军,张廷宇,吴彩凤,李维杰. 2014
[4]澳洲波尔山羊胚胎3种冷冻方法对其胚胎移植效果的影响. 洪琼花,朱士恩,田树军,冯建忠,刘国世,曾申明,张忠诚. 2007
[5]影响猪胚胎玻璃化冷冻的若干因素. 张德福,戴建军,吴彩凤,吴华莉,刘东,杨宇,张廷宇,刘伟,殷方芝,王少兵,王昭凯. 2011
[6]猪胚胎玻璃化冷冻保存技术的优化. 张德福,戴建军,吴彩凤,吴华莉,刘东,杨宇,张廷宇,刘伟,殷方芝,王少兵,王昭凯. 2009
[7]猪MII期卵母细胞冷冻前后全基因组表达谱分析. 戴建军,吴彩凤,张树山,孙玲伟,陈亚宁,张德福. 2019
[8]哺乳动物胚胎玻璃化冷冻研究进展. 周光斌,张清靖,侯云鹏,史文清,朱士恩. 2010
[9]猪胚胎冷冻保存研究进展. 钱晓飞,刘铁铮. 2004
[10]水牛冷冻胚胎分割效果的初步研究. 陈焕华,杨丽,张明,郑海英,梁贤威,黄加祥,卢克焕. 2012
[11]钌红对玻璃化冷冻牛卵母细胞线粒体Ca~(2+)的调控研究. 王娜,李崇阳,朱化彬,郝海生,王皓宇. 2017
[12]牙鲆胚胎玻璃化冷冻及解冻过程中的温度因子与玻璃化率. 田永胜,刘本伟,陈松林. 2008
[13]玻璃化冷冻对家畜卵母细胞细胞生物学性状影响的研究进展. 王晶晶,郝海生,杜卫华,刘岩,庞云渭,赵善江,闫长亮,赵学明,朱化彬. 2019
[14]白藜芦醇处理对猪孤雌激活囊胚抗冻能力的影响. 陈亚宁,吴彩凤,张树山,张德福,戴建军. 2017
[15]猪卵母细胞、胚胎玻璃化冷冻初步研究. 张德福,刘东,王邵凯,王少兵,芮荣,汤琳琳. 2005
[16]鸡胚原始生殖细胞(PGCs)玻璃化冷冻的研究. 韩威,李碧春,陈国宏,秦洁,朱云芬,周冠月,张学余. 2007
[17]凋亡抑制剂Z-VAD-FMK在猪卵母细胞冷冻保存中的应用. 钮莹芳,吴彩凤,张树山,陈亚宁,戴建军,张德福. 2017
[18]海藻糖对牛未成熟卵母细胞玻璃化冷冻的影响. 李晓霞,肖红卫,曹平华,徐志谦,张芳,张志阳,荆鹏华,禹学礼,栗颖华. 2022
[19]不同冷冻方法对水牛体外生产胚胎冷冻效果的研究. 庞春英,杨春艳,杨炳壮,李日聪,黄健,黄芬香,郑海英,覃广胜,张秀芳,梁贤威. 2011
[20]细胞松弛素B改善冷冻引起的猪卵母细胞皮质颗粒迁移障碍. 李婉君,徐皆欢,何孟纤,孔钰婷,张德福,戴建军. 2024
作者其他论文 更多>>
-
非甾体抗炎药在牛人工授精和胚胎移植中的应用
作者:郝海生;杜卫华;赵善江;赵学明;邹惠影;朱化彬
关键词:牛;非甾体抗炎药;人工授精;胚胎移植;妊娠率
-
纳米粒子在动物种质资源冷冻保存的研究进展
作者:王彦博;张笑梦;景秀娟;冯肖艺;张元庆;赵学明
关键词:纳米粒子;种质资源;冷冻保存;作用机制;应用效果
-
牛胚胎早期流产研究进展
作者:王子卓;张笑梦;冯肖艺;宋浩然;董建华;崔凯;赵学明
关键词:牛;胚胎;早期流产
-
猪精子冷冻保存研究进展
作者:张航;杨宇泽;Jesse Oluwaseun Ayantoye;董建华;潘红梅;赵学明
关键词:生猪;精子;精液;冷冻保存;冷冻效率;公猪;种质资源
-
取样后动物胚胎的冷冻保存技术研究进展
作者:董建华;杨柏高;张笑梦;冯肖艺;宋浩然;刘阳;王子卓;王彦博;李崇阳;吕丽华;赵学明
关键词:胚胎取样;PGT;冷冻保存;冷冻效率
-
季节和卵巢保存时间对绵羊卵母细胞体外发育能力的影响
作者:刘昱成;王晶晶;海桂萍;刘伟俊;万鹏程;赵学明
关键词:卵母细胞;卵巢;季节;时间;绵羊
-
气候变化条件下影响河北山前平原区小麦产量的主要气候因素分析
作者:吕丽华;刘茜;郑孟静;张经廷
关键词:冬小麦;气候因子;产量
