芝麻抗裂蒴基因SiIND1的克隆与原核表达
文献类型: 中文期刊
第一作者: 刘艳阳
作者: 刘艳阳;武轲;梅鸿献;杜振伟;崔承齐;江晓林;郑永战
作者机构: 河南省农业科学院芝麻研究中心
关键词: 芝麻;抗裂蒴基因;基因克隆;生物信息学分析;原核表达
期刊名称: 河南农业科学
ISSN: 1004-3268
年卷期: 2020 年 49 卷 005 期
页码: 63-68
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: LOC105167765基因属于KANADI(KAN)基因家族,与芝麻裂蒴性有关.从芝麻裂蒴品种豫芝11号和抗裂蒴品种郑芝InD01中分别克隆得到LOC105167765基因cDNA序列SiIND1,并进行序列生物信息学分析和原核表达分析.结果表明,豫芝11号SiIND1基因cDNA序列全长为1320 bp,编码439个氨基酸,推测的蛋白质分子质量为50.0 ku,等电点7.53,编码SHAQKYF类MYB家族的转录因子,具有GARP保守结构域,属于KAN家族.郑芝InD01 SiIND1基因cDNA序列长度为1246 bp,包括1个最大的开放阅读框900 bp,编码299个氨基酸,推测的蛋白质分子质量为32.9 ku,等电点8.37,GARP结构域发生缺失突变,翻译提前终止,可能导致基因功能丧失.将SiIND1连接到原核表达载体pET30a,并转化大肠杆菌BL21,通过IPTG诱导和SDS-PAGE电泳检测,表达的融合蛋白与预测蛋白大小相符合,进一步证实了抗裂蒴品种和裂蒴品种SiIND1基因的蛋白质表达存在差异,抗裂蒴材料SiIND1基因在翻译过程中发生提前终止.
分类号: S565.3
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