苹果光响应转录因子MdHY5表达及蛋白互作分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李慧峰

作者: 李慧峰;王小非;冉昆;何平;王海波;李林光

作者机构:

关键词: 苹果;bZIP转录因子;MdHY5;光响应;蛋白互作

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2014 年 47 卷 21 期

页码: 4318-4327

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】克隆苹果光响应过程中关键的bZIP(basic-leucine zipper)转录因子MdHY5,并进行表达分析及蛋白互作检测,为阐述苹果中MdHY5在光信号过程中的功能及作用机制奠定基础。【方法】对苹果中具有bZIP保守结构的基因设计半定量引物进行表达分析,筛选具有光响应的bZIP转录因子。对光响应的bZIP家族基因进行BLAST比对,根据同源比对分析将目的蛋白命名为MdHY5,同时对cDNA序列设计引物进行克隆;利用MEGA5软件将MdHY5蛋白与拟南芥基因组中所有的bZIP转录因子家族成员进行聚类分析,同时对蛋白进行保守结构域分析;取苹果各组织材料进行MdHY5时空表达分析;通过对MdHY5启动子序列进行预测分析,并结合拟南芥同源基因芯片数据,进一步利用RT-PCR与半定量PCR检测MdHY5对不同光质的表达响应。将MdHY5连接到原核表达载体PGEX-4T-1上,利用IPTG对转化的大肠杆菌BL21融合蛋白进行诱导表达、蛋白杂交检测,并进行蛋白纯化;利用pull down试验验证MdHY5与MdCOP1蛋白的互作。【结果】通过光响应分析,在苹果中筛选到一个bZip转录因子家族成员,聚类分析显示MdHY5基因与拟南芥AtHY5同源性最高,该基因位于苹果基因组12号染色体上,基因编号为MDP0000586302,与拟南芥AtHY5结构相似,MdHY5也含有4个外显子,3个内含子。该基因cDNA序列长度为1 112 bp,其中5′非编码区长度为214 bp,3′非编码区长度为403 bp,开放阅读框长度为495 bp,编码一个含有164个氨基酸残基的蛋白。蛋白保守域分析显示,MdHY5蛋白C端含有一个典型的亮氨酸拉链结构(bZIP domain),其中在bZIP结构域的N端含有一个核定位信号区域(NLS domain)。时空表达分析显示MdHY5在各组织中均表达,其中叶片中表达水平最高,花和种子中表达水平较低。利用PLACE对启动子进行了顺式作用元件分析发现,MdHY5启动子上含有G-box、GT-1-box、I-box等多个光响应的作用元件,而定量表达分析显示MdHY5能够被白光、蓝光、紫外光诱导,而红光对MdHY5表达没有明显影响。将构建好的融合蛋白表达载体转化BL21并进行蛋白诱导,菌体经超声波破碎后显示,融合蛋白主要在上清中存在。将诱导的MdHY5-GST蛋白分别与MdCOP1-HIS及pET-HIS蛋白孵育进行pull down试验,结果显示,MdHY5在体外能够与MdCOP1蛋白互作。【结论】MdHY5为光诱导的bZIP转录因子,是拟南芥光形态建成关键转录因子AtHY5的同源基因,与AtHY5具有类似的基因与蛋白结构,在叶中表达量最高,同时对多种光质具有表达响应,能够与MdCOP1互作。

分类号: S661.1

  • 相关文献

[1]bZIP转录因子在植物生长发育及非生物逆境响应的作用. 刘慧洁,徐恒,邱文怡,李晓芳,张华,朱英,李春寿,王良超. 2019

[2]苹果MdJAZ1基因表达及蛋白互作分析. 安秀红,厉恩茂,李敏,李壮,张修德,程存刚. 2016

[3]楸子叶片酵母文库构建及甘油二酯激酶MpDGK7互作蛋白鉴定. 冷凇凝,谭延肖,张煜,吴玉森,韩双,陈晓乐. 2024

[4]植物bZIP转录因子的研究进展. 杨颖,高世庆,唐益苗,冶晓芳,王永波,刘美英,赵昌平. 2009

[5]芹菜bZIP转录因子基因AgbZIP16的逆境响应分析. 沈迪,陈龙正,陶建平,刘洁霞,冯凯,尹莲,徐志胜,熊爱生. 2019

[6]大豆响应涝害bZIP基因Glyma04g04170的生物信息学分析及互作蛋白预测. 林延慧,唐力琼,徐靖,朱红林,王新华,王敏芬,徐冉,王效宁. 2020

[7]小麦bZIP家族转录因子的鉴定及其在盐胁迫条件下的表达分析. 毕晨曦,杨宇昕,于月华,李丹萍,史峰,马亮,孔秀英,张立超,倪志勇. 2021

[8]bZIP转录因子在植物激素介导的抗病抗逆途径中的作用. 李冬月,原文霞,郑超,王栩鸣,周洁,严成其,陈剑平. 2017

[9]谷子SibZIP8转录因子基因功能鉴定. 刘盼,张艾英,张莉. 2018

[10]大豆转录因子GmbZIP60对非生物胁迫的表达模式分析. 邢锦城,孙晨曦,洪立洲,许玲,徐照龙,张大勇. 2018

[11]大豆耐涝bZIP转录因子Glyma06g08390的生物信息学分析. 林昊,徐靖,朱红林,唐力琼,林延慧,王效宁. 2022

[12]玉米逆境胁迫响应基因ZmbZIP71的克隆与表达分析. 刘彦丹,英生,张登峰,石云素,宋燕春,白志川,王天宇,黎裕. 2011

[13]茶树bZIP转录因子基因CsbZIP1的克隆与表达定位. 曹红利,岳川,周艳华,王璐,郝心愿,杨亚军,王新超. 2014

[14]紫花苜蓿bZIP基因家族的鉴定、 进化及表达分析. 齐晓,张正社,闵学阳,孙启忠,刘文献. 2017

[15]甘蓝型油菜低温诱导下的bZIP转录因子挖掘及聚类分析. 杜春芳,刘春晴,咸拴狮,范建春,胡恺宁,李萌,涂金星,傅廷栋. 2016

[16]转GmAREB基因提高拟南芥的干旱、氧化胁迫耐性. 高世庆,陈明,徐兆师,唐益苗,李连城,马有志,赵昌平. 2011

[17]木薯MebZIP2基因克隆及其功能分析. 陈甘露,颜彦,孟宪伟,付莉莉,邱先进,丁泽红,胡伟. 2024

[18]两种不同矮蔓型西葫芦冠层光合特性的差异分析. 雷逢进,温祥珍,李亚灵,李燕,李晓琦,王宇楠. 2010

[19]贵州中部不同樱桃资源光合生理特性. 冯建文,罗垒,解璞,宋莎,韩秀梅,吴亚维. 2020

[20]生物炭对连作草莓光合特性及光响应的影响. 马丽,郭学良,齐红志,赵冰洁,王娟,刘海燕. 2020

作者其他论文 更多>>