百合肌动蛋白基因lilyActin的克隆与表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 梁云

作者： 梁云;袁素霞;冯慧颖;徐雷锋;袁迎迎;刘春;明军

作者机构：

关键词： 百合;Actin基因;基因克隆;表达分析;内参基因

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2013 年 40 卷 07 期

页码： 1318-1326

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了在百合功能基因表达研究中选择一个理想内参基因,依据岷江百合cDNA文库所获得的百合肌动蛋白(Actin)基因的EST序列,采用RACE技术进行该基因cDNA全长克隆,并利用实时荧光定量PCR分析其在不同组织中的表达模式,获得百合肌动蛋白基因cDNA全长序列(GenBank登录号:JX826390),命名为lilyActin。该基因cDNA全长1367bp,其中,5′非编码区91bp,3′非编码区233bp,开放读码框1134bp,编码377个氨基酸。序列比对发现,该基因与其它15种植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性均在80%以上,氨基酸序列的相似性达98%。进化分析显示,百合肌动蛋白与郁金香肌动蛋白的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR结果显示,该基因在百合的花蕾、叶片和鳞片组织中恒定表达,表明相对于其他物种的内参基因,lilyActin更适宜作为百合属植物的内参基因。

分类号： S682.29

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