茶树肌动蛋白基因(CsActin1)全长cDNA克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨亚军

作者： 杨亚军;王新超;马春雷

作者机构：

关键词： 茶树;肌动蛋白基因CsActin1;RACE;序列分析

期刊名称： 植物研究

ISSN： 1673-5102

年卷期： 2012 年 32 卷 01 期

页码： 71-78

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以茶树(Camellia sinensis)萌动芽为材料,根据茶树萌动芽芽抑制消减杂交文库中分离得到的肌动蛋白(actin)基因的5'-片段设计引物,利用3'-RACE技术克隆了其cDNA全长序列,该基因cDNA全长1 470 bp,命名为CsActin1(GenBank登录号HQ235647)。序列分析表明,CsActin1开放阅读框长1 134 bp,编码377个氨基酸,5'非编码区100 bp,3'非编码区236 bp。推测的蛋白质分子量为41.70 kD,等电点约为5.31,具有肌动蛋白家族的特征信号序列(YVGDEAQs.KRG和WIAKaEYDE)和肌动蛋白相关蛋白的特征信号序列(LLTEApLNPkaNR)。CsActin1与GenBank中注册的其它植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性在80%以上,氨基酸序列相似性在95%以上。与其它植物肌动蛋白的进化树分析结果表明,茶树肌动蛋白与杨树的两个肌动蛋白间的亲缘关系最为密切。并对推导的蛋白结构进行了分析。

分类号： S571.1

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