木薯sRNA测序分析及其开花相关microRNA的挖掘

文献类型： 中文期刊

第一作者： 丛汉卿

作者： 丛汉卿;龙娅丽;王荣香;孙化鹏;乔飞

作者机构：

关键词： 木薯;sRNA;microRNA;开花;表达特性

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2018 年 12 期

页码： 2427-2435

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为研究木薯花序与叶片中sRNA表达特性,探索microRNA对其开花过程的调控。本研究以木薯品种"华南八号"花序和幼叶为材料,利用RNA-seq技术进行sRNA测序分析;并筛选开花相关microRNAs进行表达特性分析。从花序和幼叶测序结果中分别获得12 092 109条和11 499 655条sRNA序列。花序中筛选出139条已知microRNAs和253条新预测microRNA,分别预测得到992和3736条靶基因;幼叶中筛选出134条已知microRNA和191条新预测microRNAs,分别预测得到979和2 603条靶基因。最终筛选出8种与开花调控相关和3种花色调控相关的microRNAs。表达分析显示,miRNAs在两样品间呈现出较大的整体性差异,并且在功能与代谢通路上也不尽相同;开花相关microRNAs中表达差异较大的为miR156、miR172和miR169,其中miR156表达量在花序中高于幼叶,而miR172表达量在花序中低于幼叶,推测其功能为抑制后续的开花过程,避免过度开花。本研究分析了木薯花序与幼叶中sRNA的整体特性,通过表达差异分析初步明确了microRNAs对木薯开花的调控,为进一步深入探索奠定了基础。

分类号： S533

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