大豆E3泛素连接酶基因GmHOS1a和GmHOS1b生物信息学分析和敲除载体构建

文献类型: 中文期刊

第一作者: 王昕

作者: 王昕;李聪;许志永;刘斌;赵涛;刘军;李宏宇

作者机构:

关键词: 大豆;GmHOS1s;CRISPR/Cas9;E3泛素连接酶;亚细胞定位;生物钟

期刊名称: 大豆科学

ISSN: 1000-9841

年卷期: 2023 年 42 卷 002 期

页码: 165-174

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: HIGH EXPRESSION OF OSMOTICALLLY RESPONSIVE GENES 1(HOS1)是植物中多种信号途径的整合因子,在植物发育、胁迫反应、光形态建成和开花调控中发挥至关重要的作用,是很有潜力的作物工程育种目标基因,但其在大豆中的功能尚未被揭示.为了揭示其在大豆中的功能,本研究利用反向遗传学,成功克隆了两个大豆HOS1基因,GmHOS1a和GmHOS1b,并通过生物信息学技术,对其蛋白结构、表达模式和功能进行了分析.进化树和结构域分析表明,GmHOS1a和GmHOS1b具有N端的环指结构域和与ELYS高度相似的保守基序,与拟南芥和水稻HOS1蛋白高度同源.亚细胞定位结果显示,GmHOS1a和GmHOS1b定位在细胞核中.Quantitative Real-time PCR(qRT-PCR)结果表明,GmHOS1a和GmHOS1b的基因表达模式相似,均在三出复叶中高度表达.48 h光周期RNA-sequencing(RNA-seq)和qRT-PCR分析表明,GmHOS1a和GmHOS1b基因的表达具有生物钟昼夜节律性,其中GmHOS1a的表达量显著高于GmHOS1b,GmHOS1a见光后表达量升高,黑暗前表达量达到峰值.为进一步探索GmHOS1a和GmHOS1b蛋白的功能,利用CRISPR/Cas9系统构建了 9个GmHOS1a和GmHOS1b基因敲除载体,通过发根检测实验,筛选出6个高效工作载体,可供后续遗传转化实验使用.本研究为阐明该基因的功能和作用机理奠定了理论基础,并提供了可供遗传转化的载体材料.

分类号: S565.1

  • 相关文献

[1]大豆E3泛素连接酶基因GmAIRP1的同源克隆及在烟草中的功能鉴定. 张雅文,沈祥娟,张静,朱美娇,张海玲,王全伟. 2019

[2]大豆基因组中TOC1同源基因的生物信息学分析. 吴卓晶,庞保平,傅永福. 2010

[3]大豆GmLCL2蛋白的多克隆抗体制备. 吴卓晶,高鹏飞,庞保平,傅永福. 2010

[4]不同Cas9启动子对大豆CRISPR/Cas9系统效率的作用分析. 牛志远,秦超,刘军,王海泽,李宏宇. 2023

[5]利用CRISPR/Cas9技术编辑GmBADH1基因改变大豆耐盐性. 石宇欣,刘欣玥,孙建强,李晓菲,郭潇阳,周雅,邱丽娟. 2024

[6]CRISPR/Cas9介导的多基因编辑系统在大豆中的应用. 关贝贝,王燕娟,陈海峰,陈水莲,沙爱华,曹东. 2021

[7]大豆GmDRR与互作基因GmDIP1的亚细胞定位及原核表达. 杨蕊,禹国龙,沈岩茹,刘春燕,傅永福,辛大伟,陈庆山. 2016

[8]大豆耐胁迫相关蛋白编码基因GmSAMDC1的克隆及表达分析. 任锐,杨凤玺,王涛,高乐,智海剑,李凯. 2018

[9]5个大豆AT-hook基因GmAHLs的克隆与定位分析. 张大勇,戚维聪,万群,刘佳,徐照龙,黄益洪,邵宏波. 2017

[10]大豆MYB转录因子基因GmMYB174的克隆及分子特性分析. 魏麦玲,裴丽丽,刘佳明,闵东红,陈明,李连城,马有志,徐兆师,张小红. 2014

[11]大豆MYB转录因子基因GmMYB174的克隆及分子特性分析. 魏麦玲,裴丽丽,刘佳明,闵东红,陈明,李连城,马有志,徐兆师,张小红. 2015

[12]大豆RNA依赖的RNA聚合酶基因GmRDR1的克隆与表达特性分析. 吴冰月,沈良,宋普文,陈华涛,崔瑾,许晓明,陈新. 2015

[13]大豆C_2H_2型锌指蛋白基因SCTF-1的克隆及功能分析. 宋冰,王丕武,付永平,范旭红,夏海峰,高玮,洪洋,王贺,张卓,马建. 2012

[14]大豆GmNramp3a基因克隆及表达分析. 刘颖,陈经烨,李小豪,陈晶晶,薛迎斌. 2023

[15]大豆转录因子GmWRKY58亚细胞定位及在非生物胁迫下的表达分析. 张红梅,刘晓庆,陈华涛,袁星星,崔晓艳,张智民,黄中文,陈新. 2018

[16]向日葵E3泛素连接酶基因克隆及表达分析. 张艳芳,孙瑞芬,郭树春,于海峰,石慧芹. 2016

[17]过表达柠条锦鸡儿CkRNF185基因减弱拟南芥对渗透胁迫的耐受性. 岳文冉,王茜,于秀敏,杨杞,韩晓东,王瑞刚,李国婧. 2019

[18]植物含跨膜域RING E3泛素连接酶研究进展. 孙林静,张融雪,苏京平,王胜军,佟卉,刘燕清,孙玥. 2020

[19]蒺藜苜蓿E3泛素连接酶U-box基因克隆及表达分析. 邵麟惠,郑兴卫,李聪. 2016

[20]莱茵衣藻APC/C复合物基因家族及CrCDC20表达谱分析. 罗秋兰,王潮岗,胡章立. 2018

作者其他论文 更多>>