新城疫病毒山东分离株F和HN基因克隆与进化分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 杨少华
作者: 杨少华;胡北侠;黄艳艳;许传田;颜世敢;张秀美
作者机构:
关键词: 新城疫病毒;基因型;强毒株
期刊名称: 西南农业学报
ISSN: 1001-4829
年卷期: 2011 年 24 卷 04 期
页码: 1547-1551
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 选取山东2007~2008年的5株NDV流行株,克隆融合蛋白(F)和血凝素-神经氨酸酶(HN)基因全长并测序。结果表明,5个分离株F基因长度为1662 bp,编码553个氨基酸。F蛋白裂解位点的氨基酸序列均为112R-R-Q-K-R-F117,符合强毒株F基因裂解位点的氨基酸序列特征。对F基因47~420 nt序列进行比对,发现4株鸡源毒株基因型为Ⅶd,另一鸽源毒株基因型为Ⅵ。5个分离株间F基因核苷酸和氨基酸序列同源性分别为88.8%~99.7%和94%~99.3%,与LaSota、Clone30、F48E9的氨基酸同源性分别为88.4%~89.5%、87.7%~88.8%、90.8%~92.4%。HN基因长度为1801bp,编码571个氨基酸,5个毒株均含13个半胱氨酸残基且位置保守。与LaSota的氨基酸同源性为87.2%~88.8%,与8个山东NDV流行株的同源性为89.8%~98.6%。
分类号: S852.65
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