斑石鲷卵鞭虫病病原的分子鉴定与系统发育分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 付泉洁

作者: 付泉洁;范超;谢国驷;叶仕根;史成银

作者机构:

关键词: 斑石鲷;眼点淀粉卵涡鞭虫;核糖体DNA;分子鉴定;系统发育分析

期刊名称: 安徽农业科学

ISSN: 0517-6611

年卷期: 2017 年 45 卷 13 期

页码: 135-140

摘要: [目的]对严重危害斑石鲷鱼苗的卵鞭虫病病原——渤海分离株(Bohai-1407 isolate)进行分子生物学鉴定和系统发育分析。[方法]设计4对特异性引物,应用PCR方法克隆并测定渤海分离株的核糖体DNA(rDNA)序列;应用Blast比对分析渤海分离株rDNA的结构;依据rDNA序列,分别构建10种胚沟科鞭毛虫和19株眼点淀粉卵涡鞭虫分离株/克隆的系统发育树,分析渤海分离株的系统分类地位。[结果]扩增出了渤海分离株的4个DNA片段,拼接出长度为6 530 bp的r DNA操纵子序列;该操纵子由74 bp的部分外转录间隔区(ETS)、1 813 bp的小亚基(SSU)、352 bp的内转录间隔区1(ITS1)、159 bp的5.8S、698 bp的内转录间隔区2(ITS2)和3 388 bp的大亚基(LSU)串联而成,3'端还有46 bp的部分非转录间隔区(NTS);渤海分离株与眼点淀粉卵涡鞭虫宁德株(Ningde1412)的rDNA序列相似性高达99.5%;依据SSU序列建立了包含10种胚沟科鞭毛虫的系统发育树,渤海分离株与世界各地分离到的眼点淀粉卵涡鞭虫聚类在一起,将其鉴定为眼点淀粉卵涡鞭虫;依据ITS1和ITS2序列建立了包含19株眼点淀粉卵涡鞭虫的2个系统发育树,渤海分离株与从美国弗罗里达盐水池塘中分离到的墨西哥湾分离株FL_21(DQ490260.1)总是聚类在一起。[结论]斑石鲷卵鞭虫病的病原——渤海分离株可以鉴定为眼点淀粉卵涡鞭虫,该分离株与墨西哥湾分离株FL_21的亲缘关系最近。

分类号: S941.5

  • 相关文献

[1]硫酸铜对斑石鲷幼鱼的急性毒性及对眼点淀粉卵涡鞭虫的杀灭效果. 范超,史成银. 2016

[2]帘蛤科贝类rDNA内转录间隔区序列的研究(英文). 程汉良,夏德全,吴婷婷,孟学平,吉红九,董志国. 2006

[3]环介导恒温扩增技术快速检测米氏凯伦藻方法的建立. 张凤英,徐兆礼,马凌波,郑俊斌,缪宇平,陆亚男. 2009

[4]瘿蚊科3种昆虫核糖体DNA的克隆及序列分析. 段云,郭培,巩中军,苗进,李彤,蒋月丽,武予清. 2020

[5]热带油茶根腐病病原菌的分子鉴定. 赵志祥,严婉荣,肖敏,肖彤斌,雷菲. 2020

[6]黑龙江省扶余市麦穗鱼舌状绦虫裂头蚴的分子鉴定和系统发育分析. 陈秀琴,邱阳元,郑敏,林甦,江斌,王劭,黄梅清. 2024

[7]几种帘形目贝类RDNA ITS序列的比较. 刘相全,包振民,胡景杰,王师,方建光,王如才. 2007

[8]中华绒螯蟹核糖体DNA全序列分析. 俞菊华,李红霞,戈贤平,李建林,唐永凯. 2010

[9]rDNA ITS序列在果树真菌病害研究中的应用. 索相敏,王献革,李学营,郝婕,鄢新民,冯建忠. 2015

[10]江苏省小麦禾谷孢囊线虫群体核糖体DNA-ITS区序列分析. 梁中伟,裴世安,乐秀虎,李红梅,彭德良. 2010

[11]香菇栽培种线粒体DNA和核糖体DNA多态性研究初探. 陈春涛,张引芳,姚占芳,周文丽. 1997

[12]我国耳萝卜螺ITS及5.8SrDNA的克隆及序列分析. 王瑞爱,刘国华,王春仁,张念章,翁亚彪. 2013

[13]珠母贝属6个种的ITS 2分子标记研究. 喻达辉,朱嘉濠. 2005

[14]西藏尼木县绵羊背带属线虫形态及分子分类鉴定. 夏晨阳,刘建枝,胡敏,杨新,石斌,唐文强. 2017

[15]我国耳萝卜螺ITS及5.8S rDNA的克隆及序列分析. 王瑞爱,刘国华,王春仁,张念章,翁亚彪. 2013

[16]几种典型藻华生物的分子分类学分析. 侯建军,赖红艳,黄邦钦,刘绍平. 2008

[17]印度华首线虫核糖体和线粒体基因序列多态性分析. 周成艳,马君,刘伟,徐前明,朱兴全. 2019

[18]海南普通野生稻不同居群rDNA ITS区序列的比较分析. 郭安平,彭于发,刘恩平,孔华,林海妹,贺立卡. 2008

[19]芭蕉属rDNA的ITS序列分析. 王静毅,陈雪婷,马子龙,武耀廷. 2013

[20]海南普通野生稻不同居群rDNAITS区序列的比较分析. 郭安平,彭于发,刘恩平,孔华,林海妹,贺立卡. 2008

作者其他论文 更多>>