桃钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶基因家族鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张杰伟

作者： 张杰伟;杨育峰;任飞;谢华;魏建华

作者机构：

关键词： 钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶;桃;基因家族;进化分析

期刊名称： 科学技术与工程

ISSN： 1671-1815

年卷期： 2016 年 24 期

页码： 127-131

收录情况： 北大核心

摘要： 钙调磷酸酶B类似蛋白互作蛋白激酶(CIPKs)在植物生长发育和抗逆过程中发挥着重要作用。为了对桃中CIPK家族基因进行系统分析,利用桃基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定桃CIPK家族基因的基因结构、染色体定位和编码蛋白,通过序列比对进行进化和分类分析。结果表明,桃基因组中含有18个CIPK基因,分布于桃的6条染色体上。MEME和Pfam保守结构域分析显示,桃CIPK蛋白均含有2个保守的PKinase和NAF结构域。进化树分析表明CIPKs可分为2个亚家族。Net Phos 2.0 Server结果显示Pp CIPKs存在着大量的丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)及酪氨酸(Tyr)潜在磷酸化位点。以上结果将为今后揭示桃CIPK蛋白的功能提供重要的理论基础。

分类号： Q943.2

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