基于不同靶基因的3种住肉孢子虫PCR检测方法比较

文献类型: 中文期刊

第一作者: 孙滔

作者: 孙滔;米荣升;张烨华;张世杰;张晓丽;贾海燕;曾江勇;黄燕;龚海燕;韩先干;陈兆国;赵权

作者机构:

关键词: 18S rRNA基因;28S rRNA基因;cox1基因;PCR方法;住肉孢子虫

期刊名称: 动物医学进展

ISSN: 1007-5038

年卷期: 2020 年 41 卷 012 期

页码: 1-6

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为筛选敏感、特异的住肉孢子虫(Sarcocystis spp.)PCR检测方法,对以住肉孢子虫18S rRNA、28S rRNA和线粒体细胞色素C氧化酶I基因(cox 1)的部分片段为靶基因设计的3套引物建立的PCR方法进行敏感性和特异性试验,并对田间采集的100份牛源和猪源肌肉样品进行检测.结果显示,以18S rRNA和28S rRNA为靶基因的PCR检测方法的敏感性相似,DNA最小检出量均为1×10-2 ng/μL;而以cox 1为靶基因的PCR检测方法敏感性相对较低,DNA的最低检出量为1 ng/μL.对7种不同寄生虫DNA进行特异性试验,结果以cox 1基因为靶基因的PCR方法特异性较好,仅能够扩增出枯氏住肉孢子虫(Sarcocystis cruzi)DNA;以18S rRNA为靶基因的PCR法,除枯氏住肉孢子虫外,刚地弓形虫和微小隐孢子虫也有相似扩增条带;以28S rRNA为靶基因的PCR法,除枯氏住肉孢子虫外,刚地弓形虫、微小隐孢子虫和欧猥迭宫绦虫DNA也能扩增出杂带,但大小不符.利用3种方法对100份牦牛和猪肉样品进行扩增,发现以18S rRNA、28S rRNA和cox 1为靶基因的PCR法的阳性率分别为36.00%(36/100)、43.00%(43/100)和38.00%(38/100).结果表明,以cox 1为靶基因的PCR法有良好的特异性,适合用于田间动物肌肉样品中住肉孢子虫的检测,为开展动物住肉孢子虫病分子流行病学及防控研究提供了依据.

分类号: S852.723%S851.34

  • 相关文献

[1]魁蚶(Scapharca broughtonii)不同地理群体的遗传多样性及种群结构. 刘寒苗,吴彪,刘志鸿,杨爱国,周丽青,孙秀俊. 2017

[2]香蕉穿孔线虫28S rRNA基因的D2/D3区序列分析. 彭德良,黄文坤. 2008

[3]塔里木马鹿自然感染住肉孢子虫病的病理学观察. 乔军,孟庆玲,才学鹏,高庆华,廖秋萍,贾桂珍. 2007

[4]甘肃省部分地区绵羊膈肌住肉孢子虫的感染情况调查与分子生物学鉴定. 孙继文,游杰,尚小粉,王贺,李媛媛,宋蓓蓓,贾万忠,马永华. 2023

[5]甘薯和巴西牵牛18S rRNA基因的克隆和序列分析. 王振东,王晓华,乔奇,张德胜,秦艳红,田雨婷,张振臣. 2011

[6]云南猪场隐孢子虫分子流行病学调查及种类鉴定. 韩建强,石莲琴,吴杰,李朝,朱兴全,邹丰才,罗满林. 2018

[7]早熟艾美耳球虫上海株的分离鉴定及生物学特性观察. 陈兆国,米荣升,于慧珠,郝言明,胡义彬,黄燕,李正锋,李艳,林矫矫. 2010

[8]牛泰勒虫18S rRNA基因序列比较研究. 刘爱红,关贵全,刘军龙,李有全,马米玲,牛庆丽,任巧云,殷宏,罗建勋. 2009

[9]基于18S rRNA基因测序基础上的锥虫分子分类学. 刘光远,田占成,龚真莉,谢俊仁,李知新. 2009

[10]新疆塔城地区马梨形虫感染的分子生物学诊断及分析. 于伟伟,孟庆玲,乔军,潘多荣,才学鹏,陈创夫. 2017

[11]草鱼TBK1基因荧光定量PCR检测方法的建立. 张林,张浪,周剑光,甘金华,张涛,何力. 2022

[12]多浆旱生植物霸王18S rRNA基因的克隆及序列分析. 胡静,谢俊仁,王锁民. 2012

[13]高通量测序分析西沙晋卿岛两种草食性鱼类对大型海藻的摄食差异. 吴鹏,王腾,刘永,李纯厚,凌娟,肖雅元,林琳. 2023

[14]奶牛泰勒虫病的诊断及病原体18S rDNA分析. 于伟伟,孟庆玲,乔军,卢海亭,贡莎莎,程子兵,张金生,才学鹏,陈创夫. 2017

[15]慢病毒生产卵泡抑素转基因绵阳PCR检测方法的建立(英文). 张宁,王晨懿,张雪梅,刘晨曦,贺三刚,李文蓉,刘明军. 2014

[16]2014—2018年浙江省3种猪支原体流行病学调查. 徐丽华,兰胜芝,李军星,余斌,张鹏超,李宝臣,袁秀芳. 2019

[17]细粒棘球绦虫G3基因型(水牛株)的研究进展. 刘全元,闫鸿斌,娄忠子,李立,史万贵,刘聪暖,殷宏,贾万忠. 2013

[18]新疆北疆部分地区牛羊包虫病流行病学调查与cox1和nad1基因分析. 热衣汗?玉素甫,贾万忠,闫鸿斌,吴耀东,吴燕涛,高佳敏,李莲瑞,石长青. 2020

[19]PCR方法在抗虫转基因水稻外源基因漂移风险研究中的应用. 牛蓓,常丽娟,宋君,王东,尹全,刘文娟. 2016

[20]细粒棘球绦虫G3基因型(水牛株)的研究进展. 刘全元,闫鸿斌,娄忠子,李立,史万贵,刘聪暖,殷宏,贾万忠. 2013

作者其他论文 更多>>