绵羊痘病毒固原株L2R基因的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李杨

作者： 李杨;颜新敏;吴国华;李健;叶奕优;赵志荀;朱海霞;张强

作者机构：

关键词： 羊痘病毒;L2R基因;基因克隆;生物信息学

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2017 年 44 卷 01 期

页码： 201-207

收录情况： 北大核心

摘要： 为分析绵羊痘病毒L2R蛋白的分子特征,本试验提取了绵羊痘病毒固原株(GY)的基因组DNA,设计L2R基因引物,对L2R基因进行扩增,将扩增的基因连接到pGEM-T Easy载体后转化到大肠杆菌Trans 5α感受态细胞,筛选阳性克隆,进行序列测序。利用生物信息学软件对L2R基因序列进行预测分析。结果显示,L2R基因序列含有一个由279个核苷酸组成的开放阅读框,编码92个氨基酸残基组成的多肽,蛋白质分子质量理论值为10.92ku,理论等电点为6.56。该蛋白质二级结构组成分别是α-螺旋占69.57%,β-折叠占9.78%,无规则卷曲占8.70%,延伸链占11.96%。多序列比对分析结果显示,不同羊痘病毒分离株L2R序列高度保守。进化树分析结果显示,GY株与NK、TU及SA株在一个分支,表明它们之间亲缘关系较近。本试验结果为进一步研究L2R蛋白的生物学功能和羊痘病毒早期蛋白的分子相互作用奠定了基础。

分类号： S852.654

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