南非2型口蹄疫病毒VP1基因的核苷酸及其氨基酸序列分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘亚丽

作者： 刘亚丽;丁耀忠;马小元;张杰;张永光

作者机构：

关键词： 口蹄疫病毒;南非型;VP1基因;序列分析;核苷酸序列;氨基酸序列

期刊名称： 黑龙江畜牧兽医

ISSN： 1004-7034

年卷期： 2016 年 09 期

页码： 22-26

收录情况： 北大核心

摘要： VP1基因的遗传衍化关系是口蹄疫病毒分型的依据,而且许多重要的抗原位点也都位于VP1蛋白上。为了对南非2型口蹄疫病毒(SAT2-FMDV)VP1的编码基因序列及其氨基酸序列进行分析,为南非2型口蹄疫的诊断及疫苗设计提供理论基础,试验从NCBI下载大量的南非1/2/3型口蹄疫病毒(SAT1/2/3-FMDV)的1D2A2B基因片段,通过序列分析选择相似性较低的序列代表SAT1/2/3,将选中的代表序列连接于p UC57载体上进行合成,再对合成的含目的序列的穿刺菌进行划板、挑单克隆、摇菌、提质粒,得到重组质粒初步进行酶切鉴定后进行测序,测序正确后采用DNAStar软件包对这些合成序列进行分析。结果表明:SAT2-FMDV VP1的编码基因核苷酸序列变异度较大;虽然SAT2口蹄疫病毒VP1蛋白上主要抗原位点位置与其他血清型的差异性并不大,但是关键氨基酸已发生变化。

分类号： S852.65

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