结球甘蓝核基因组密码子使用偏爱性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 仪登霞

作者： 仪登霞;杨丽梅;方智远;刘玉梅;庄木;张扬勇;刘基生;刘博;武剑

作者机构：

关键词： 甘蓝;密码子用法;高频密码子;密码子偏爱性

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2013 年 40 卷 10 期

页码： 1927-1934

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据甘蓝测序结果,利用CodonW软件对结球甘蓝的48 000个蛋白质编码基因序列进行了分析,计算出同义密码子相对使用频率,确定了TCT、CCT、AGA、GTT、GCT、GAT等6个高频密码子。将甘蓝与大肠杆菌、拟南芥、棉花、水稻的密码子使用频率进行了比较,发现甘蓝密码子使用偏爱性与同为双子叶植物的拟南芥、棉花基本一致,而与大肠杆菌及单子叶植物水稻均具有较大差异。以甘蓝密码子用法分析结果为依据,对Bt cry1C抗虫基因进行了密码子的改造,得到了具有甘蓝密码子使用特点的cry1C基因序列,为甘蓝的转基因研究奠定了分子基础。

分类号： S635.1

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