长喙壳菌侵染甘薯的转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 杨冬静
作者: 杨冬静;高方园;陈晶伟;马居奎;唐伟;梁昭;张成玲;孙厚俊;谢逸萍
作者机构:
关键词: 甘薯;长喙壳菌;转录组测序;差异表达基因;致病机理
期刊名称: 江苏农业学报
ISSN: 1000-4440
年卷期: 2025 年 41 卷 007 期
页码: 1320-1331
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 甘薯黑斑病是由长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata Ellis et Halsted)侵染引起的,该病害是甘薯重要病害之一,在田间生产和贮藏期均可发生,严重影响甘薯的产量和品质。为了明确长喙壳菌对甘薯黑斑病的致病机理,本研究以甘薯黑斑病抗病品种南京92和感病品种徐薯18为试验材料,采用针刺接种孢子悬浮液的方法人工接种甘薯长喙壳菌,分别于接种当天与接种后第1 d、第3 d、第7 d取样,利用转录组测序技术进行测序分析。转录组测序结果显示,与接种当天相比,长喙壳菌接种至南京92薯块后第1 d、第3 d和第7 d上调差异表达基因(DEGs)分别为1 124个、1 713个和2 032个,下调DEGs分别为869个、1 042个和1 005个;长喙壳菌接种至徐薯18薯块后第1 d、第3 d和第7 d上调DEGs分别为901个、1 625个和1 957个,下调DEGs分别为1 017个、976个和1 032个。GO功能富集分析结果表明,差异表达基因主要富集于生物过程类别的生物进程、代谢进程、单一生物进程以及细胞组分类别的细胞、细胞部分、细胞器等。KEGG通路富集的主要通路为代谢途径。维恩图分析结果表明,长喙壳菌接种至南京92薯块后不同时间点共有DEGs为1 545个,接种至徐薯18薯块后不同时间点共有DEGs为1 116个,对这些DEGs进行交互分析,发现接种至2个甘薯品种薯块后在各时间点共有的DEGs有925个。对925个共有DEGs进行KEGG聚类分析,结果表明,这些DEGs主要被富集到代谢通路中,如碳水化合物代谢、脂质代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢、辅因子和维生素代谢以及能量代谢等途径中,进一步对这些DEGs进行筛选,得到相对表达量高于1.00、持续上调表达并且差异表达倍数达到40倍以上的关键致病基因共20个。本研究结果为深入研究长喙壳菌致病分子机理奠定了重要基础。
分类号: S435.31
- 相关文献
[1]甘薯块根响应长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata)侵染的转录组测序分析. 杨冬静,马居奎,唐伟,陈晶伟,高方园,张成玲,孙厚俊,谢逸萍. 2022
[2]双孢蘑菇6个菌株不同发育阶段的转录组分析. 施肖堃,卢园萍,蔡志欣,郭仲杰,陈美元,廖剑华. 2019
[3]基于转录组学的不同色系蝴蝶兰花色苷差异积累分析. 张加强,史小华,刘慧春,马广莹,邹清成,朱开元,周江华,毛军铭. 2018
[4]基于RNA-Seq筛选ALV-J感染汶上芦花鸡肝差异表达致病相关基因. 张会永,吴井生,杨剑波,俞燕,薛倩,殷建玫,朱云芬,朱静,苏一军,李国辉,韩威. 2020
[5]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018
[6]基于瘤胃转录组探究双峰驼沙漠适应性分子机制. 方艳,周俊文,关伟军,蒋琳,浦亚斌,赵倩君,何晓红,马月辉. 2021
[7]利用RNA-Seq技术分析草鱼生长性状相关基因和SNP标记. 孙雪,李胜杰,姜鹏,杜金星,周家辉,白俊杰. 2021
[8]芝麻根系响应铝胁迫的比较转录组分析. 梁俊超,赵云燕,颜小文,颜廷献,王郅琪,孙建,饶月亮,周红英,乐美旺. 2023
[9]鸭胚胎发育中后期胸肌发育阻滞的RNA-seq分析. 刘宏祥,徐文娟,朱春红,陶志云,宋卫涛,章双杰,李慧芳. 2018
[10]基于转录组测序技术挖掘大豆蛋白质合成相关基因. 郭静文,史晓蕾,刘茜,赵青松,邸锐,刘兵强,闫龙,王凤敏,张孟臣,赵宝华,杨春燕. 2019
[11]哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析. 李梅,张林,庞莉,孙青,蒋细良. 2015
[12]基于转录组测序筛选鸡皮肤毛囊性状相关基因和关键通路. 陈春,魏岳,黄聪,黎观红,谢金防,武艳平. 2023
[13]不同磷酸盐浓度下浮游虫黄藻的转录组比较分析. 李月,王云龙,欧阳珑玲. 2022
[14]长日照条件下2个热带玉米自交系的转录组差异分析. 高媛,王小利,涂亮,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,吴迅,陈泽辉. 2022
[15]野生稻基因导入系W6023对白叶枯菌的抗谱及转录组差异表达基因分析. 张明伟,徐飞飞,郝巍,王春连,赵开军. 2017
[16]桃响应葡萄座腔菌侵染的转录组学分析. 刘勇,王富荣,王会良,艾小艳,朱炜,孙中海,吕亮,龚林忠,何华平. 2024
[17]转录组测序技术在猪繁殖与呼吸综合征病毒研究中的应用. 梁婉,周丹娜,彭忠,杨克礼,段正赢,郭锐,刘威,吴斌,陈文杰,孟丽,田永祥. 2019
[18]红望天眼金鱼皮肤变色机制的转录组学分析. 李荣妮,王赛赛,田仲,孙砚胜,张博,张欣. 2022
[19]基于转录组测序的金银花提取物抗鸽源新城疫病毒感染的作用机制研究. 莫红芳,石宗承,杨燕燕,俸云,虞霖田,石德顺,熊晓妍. 2024
[20]西方蜜蜂工蜂不同虫态发育的转录组学分析. 宋文菲,胡宗文,苗春辉,余玉生,杨爽,李亚辉. 2022
作者其他论文 更多>>
-
甘薯茎线虫病复合抗性遗传分析与QTL定位
作者:闫会;马居奎;李臣;马猛;张艾岑;张成玲;张允刚;李强
关键词:甘薯;茎线虫病;复合抗性;QTL定位
-
甘薯抗病基因及其功能的研究进展
作者:杨冬静;高方园;马居奎;唐伟;陈晶伟;梁昭;张成玲;孙厚俊
关键词:甘薯;基因克隆;真菌;细菌;线虫;基因功能;抗病性
-
甘薯抗茎线虫病的QTL定位与分析
作者:赵冬兰;马居奎;肖世卓;周志林;赵凌霄;王洁;戴习彬;孙厚俊;曹清河
关键词:甘薯;F1群体;抗茎线虫病;QTL定位;候选基因
-
种植密度与施肥量对大豆产量和品质的影响
作者:潘文婧;梁昭;刘忠民;孙亚男;丰少伟;高陆思;景玉良;王金星
关键词:大豆;黑龙江省;叶面肥;种植密度;产量;品质
-
薯类作物主要病虫害综合防治理论与实践
作者:高玉林;徐进;闫俊杰;董莎萌;李素华;周文武;孙厚俊;杨志辉;邱思鑫;刘霞;周倩;赵志坚
关键词:马铃薯;甘薯;病虫害;综合防治
-
水稻大面积提产增效技术集成创新与应用-以广德为例
作者:王亚梁;朱德峰;申红芳;万克江;朱晖;张均华;王丹英;符冠富;万品俊;唐伟;陈惠哲;李春生;徐树仁
关键词:水稻;提产增效;整县制推进;技术集成创新
-
植物生长调节剂复配对甘薯薯苗生长及产量的影响
作者:陈晶伟;马居奎;高方园;张成玲;杨冬静;唐伟;谢逸萍;孙厚俊
关键词:植物生长调节剂;二氢卟吩铁可溶性粉剂;甘薯;产量;品质
