巴西橡胶树HbMYC1基因的克隆及序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 高静
作者: 高静;程汉;黄华孙;田维敏
作者机构:
关键词: 巴西橡胶树;RACE;MYC;茉莉酸
期刊名称: 热带作物学报
ISSN: 1000-2561
年卷期: 2007 年 28 卷 04 期
页码: 26-31
收录情况: CSCD
摘要: 从GenBank中搜索到1条来自橡胶树的MYC(Myelocytomatosis)家族基因EST序列,以该序列为保守区,通过RACE技术获得了该基因全长cDNA序列,共1817bp。通过BLAST工具搜索GenBank数据库,结果表明,该cDNA序列同其他植物的MYC家族基因高度同源,认为该cDNA序列为橡胶树MYC家族成员。利用GenScan和Clastal X对该序列进行分析,推测其编码区长度为1428bp,编码476个氨基酸。生物信息学分析结果表明,巴西橡胶树的MYC基因编码的氨基酸序列与其他物种的相似性很高,同时推导的蛋白质序列中还存在着1个螺旋-环-螺旋的DNA结合区域和1个核定位信号,表明克隆到的基因是1个MYC家族成员的转录因子。
分类号: S794.1
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