BSA联合转录组分析发掘西瓜叶片黄化候选基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张朝阳

作者： 张朝阳;程瑞;徐兵划;顾妍;黄大跃;孙玉东

作者机构：

关键词： 西瓜;黄化;BSA;遗传图谱;基因定位

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2024 年 40 卷 001 期

页码： 165-173

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 叶片是植物重要的功能器官之一,不仅是植株进行光合作用的主要场所,也可作为重要的形态标记,应用于育种中.叶片颜色作为形态标记,不仅可用于苗期杂种的清除,亦可用于种子纯度的测定.以西瓜全生育期叶片黄化突变体纯合自交系ly104为母本(P1)、绿叶自交系w3为父本(P2),通过杂交创制F1代、F2代、BC1代群体.遗传分析结果表明,该突变体的叶片黄化由单隐性基因控制.采用混合分组分析(BSA)进行初定位,通过简化基因组测序(RAD)开发全基因组单核苷酸多态性(SNP)标记构建西瓜高密度遗传图谱,将西瓜叶片黄化基因定位于 2 号染色体13 950 306~15 517 591 bp(大小约为1.57 Mb).以西瓜97103v2为参考基因组,该区间包含24个注释基因.对P1(P1Y)、P2(P2G)和F2代群体中黄叶(F2Y)、绿叶(F2G)株系进行转录组水平分析,结果表明,目标区间内基因 Cla97C02G035950、Cla97C02G036010、Cla97C02G036020、Cla97C02G036060在黄化叶片与正常绿叶材料中的表达量差异显著,可能是西瓜叶片的黄化候选基因.研究结果可为进一步解析西瓜叶片黄化基因功能和生物学特性奠定重要基础.

分类号： S651.01

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