桃叶片低温响应转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 时梦
作者: 时梦;冀晓昊;杨兴旺;王莹莹;王海波;王孝娣
作者机构:
关键词: 桃;叶片;低温;转录组分析
期刊名称: 华北农学报
ISSN: 1000-7091
年卷期: 2023 年 38 卷 0z1 期
页码: 49-57
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 抗寒是桃育种工作重要的目标性状,受多个基因的调控,转录组测序是对特定生理条件下的转录本进行测序分析,用以深入探究桃叶片低温响应的分子机制.以熊岳巨桃的叶片为试验材料对4℃低温(LT)处理下和正常叶片(RT)进行转录组测序分析.利用DESeq2 进行差异表达分析,获得72 个上调差异表达基因和 3 个下调表达基因.KEGG代谢通路分析差异表达基因的代谢通路,并进行蛋白的互作预测.结果显示,低温处理的叶片呈现卷曲、变黄和失水的生理状态,差异代谢基因主要富集在植物病原体互作、MAPK信号通路和次生物质代谢积累等途径.MYC2、SPCH和Pti4~6 转录因子可能在响应冷胁迫中调节低温带来的伤害中起到重要作用,MYC2 和CBF蛋白预测相互作用,且分别与多个蛋白互作.本研究表明,有多个代谢途径共同响应桃叶片的低温胁迫,还预测到了可能在冷反应调节途径中起到关键作用的相关转录因子,为探究桃响应冷胁迫的分子机制打下基础.
分类号: S662.03%Q78
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