广东省猪圆环病毒2型毒株分离及全基因序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孟张丽
作者: 孟张丽;梁鹏帅;夏平安;刘燕玲;李艳;蒋智勇;蔡汝健;宋长绪
作者机构:
关键词: 猪圆环病毒2型;全基因序列;序列分析
期刊名称: 广东农业科学
ISSN: 1004-874X
年卷期: 2014 年 41 卷 07 期
页码: 155-160
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了解广东省猪圆环病毒2型(PCV2)的流行、变异及进化情况,对2013年广东省多个猪场发生PCV2感染的病猪血清进行PCV2病毒分离,参考GanBank上已发表的PCV2全基因序列,设计3对引物,用PCR方法扩增其全基因序列,测序并进行序列分析。结果分离到9株PCV2毒株,全基因序列长度都为1 767 bp。同源性分析表明,9株PCV2分离株核苷酸同源性为93.6%~99.4%,与2012年分离株同源性为94.5%~99.7%,与2011年分离株同源性为94.2%~99.7%,与GenBank中其他PCV2分离株的同源性为93.2%~99.7%。9株PCV2的ORF2核苷酸及其推导的氨基酸序列同源性分别为89.0%~99.9%和86.4%~100%,存在一定的变异。基因型分析表明,有5株属于PCV2d,3株属于PCV2b,1株属于PCV2a。对2011—2013年分离的PCV2基因组特征进行分析,发现PCV2核苷酸序列比较稳定,与世界其他分离株也具有较高的同源性。
分类号: S852.651
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