广东省猪圆环病毒2型毒株分离及全基因序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 孟张丽
作者: 孟张丽;梁鹏帅;夏平安;刘燕玲;李艳;蒋智勇;蔡汝健;宋长绪
作者机构:
关键词: 猪圆环病毒2型;全基因序列;序列分析
期刊名称: 广东农业科学
ISSN: 1004-874X
年卷期: 2014 年 41 卷 07 期
页码: 155-160
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为了解广东省猪圆环病毒2型(PCV2)的流行、变异及进化情况,对2013年广东省多个猪场发生PCV2感染的病猪血清进行PCV2病毒分离,参考GanBank上已发表的PCV2全基因序列,设计3对引物,用PCR方法扩增其全基因序列,测序并进行序列分析。结果分离到9株PCV2毒株,全基因序列长度都为1 767 bp。同源性分析表明,9株PCV2分离株核苷酸同源性为93.6%~99.4%,与2012年分离株同源性为94.5%~99.7%,与2011年分离株同源性为94.2%~99.7%,与GenBank中其他PCV2分离株的同源性为93.2%~99.7%。9株PCV2的ORF2核苷酸及其推导的氨基酸序列同源性分别为89.0%~99.9%和86.4%~100%,存在一定的变异。基因型分析表明,有5株属于PCV2d,3株属于PCV2b,1株属于PCV2a。对2011—2013年分离的PCV2基因组特征进行分析,发现PCV2核苷酸序列比较稳定,与世界其他分离株也具有较高的同源性。
分类号: S852.651
- 相关文献
[1]甘薯杆状病毒湖南分离物基因组全序列测定及比较分析. 黄艳岚,张超凡,邹学校. 2019
[2]猪圆环病毒2型天津株的全基因组克隆与序列分析. 李海花,李秀丽,张莉,孙英峰,任卫科,路超,田向学. 2014
[3]两株猪圆环病毒2型的分离鉴定和小鼠致病性试验. 郭佳慧,肖琦,汪伟,秦爱建,何孔旺. 2019
[4]猪圆环病毒2型滨州分离株全基因组的克隆与序列分析. 张文通,李峰,魏凤,苗立中,吴家强,沈志强. 2015
[5]2株猪圆环病毒2型ORF2的克隆及序列分析. 辜吉秀,刘艳红,尹双辉,宋冰,刘湘涛. 2008
[6]猪圆环病毒2型广东分离株ORF2基因的克隆和序列分析. 沈海燕,刘志成,郭慧霞,周恒,朱余军,张春红. 2014
[7]两株猪圆环病毒2型病毒的分离鉴定及其序列分析. 郭容利,何孔旺,钟书霖,温立斌,潘群兴. 2009
[8]猪圆环病毒2型GD株ORF2基区的序列分析. 宋长绪,赵亚华,蒋智勇,王贵平,高向阳. 2005
[9]2008~2011年中国部分地区猪圆环病毒2型的分子流行病学调查. 李玲,李国新,周艳君,童武,王礞礞,童光志. 2012
[10]猪圆环病毒2型快速直接PCR检测方法的建立与流行病学调查. 徐引弟,闫静娟,焦文强,王治方,张青娴,朱文豪,李海利,王克领. 2018
[11]猪圆环病毒2型吉林分离株全基因组的克隆与序列分析. 杨博超,王凤雪,温永俊,李建喜,杨志强,武华. 2013
[12]6株猪圆环病毒2型山东分离株ORF2基因的克隆与序列分析. 王可,孙健全,孔文涛,孔健,孙芝兰. 2010
[13]猪圆环病毒2型河北株的全基因组克隆与系统进化分析. 王光祥,郑海学,刘湘涛,尚佑军,常艳燕,靳野. 2008
[14]猪圆环病毒2型山西株全基因组序列分析. 孟帆,吴忻,姚敬明,樊振华,刘文俊,王娟萍,韩一超,薛翼鹏,米瑞娟,李玉斌. 2016
[15]猪圆环病毒2型的分离鉴定及其全基因组序列分析. 汪磊,赵宝磊,冯华,刘运超,魏蔷,张改平. 2018
[16]PCV2海南株全基因组的克隆与序列分析. 曹宗喜,郑心力,张艳,叶保国,林哲敏,王峰. 2015
[17]猪圆环病毒2型2015JS株的分离鉴定及全基因序列分析. 徐祥兰,王小敏,曹东阳,茅爱华,汪伟,芮荣,何孔旺. 2016
[18]猪圆环病毒2型XJ-SW株全基因组的克隆与序列分析. 黄新,康立超,韩猛立,何延华,钟发刚. 2012
[19]一株猪圆环病毒2d基因型毒株的全基因组序列及其衣壳蛋白的小鼠免疫原性分析. 李畅,周平,温平,杨克礼,刘威,郭锐,刘泽文,袁芳艳,高婷,宋浩菲,田永祥,周丹娜. 2023
[20]猪圆环病毒2型甘肃株全基因组克隆及序列分析. 贾怀杰,王晓霞,房永祥,陈国华,李玩生,窦永喜,李克斌,瞿惠玲,景志忠. 2010
作者其他论文 更多>>
-
不同谷子品种富硒能力及外源硒协同增效作用的研究
作者:黄子鹏;魏丹;迟凤琴;姚磊;丁建莉;李艳;金梁;何义利;李沛
关键词:谷子;叶面施硒;增效剂;籽粒硒含量;籽粒品质
-
长期施肥对水稻土典型氨氧化菌和全程氨氧化菌种群活性和丰度的影响
作者:张小琴;尹昌;李政;唐旭;李艳;吴春艳
关键词:全程氨氧化菌;硝化活性;种群丰度;有机肥;化肥;实时荧光定量PCR技术
-
1株致仔猪脑膜炎的猪链球菌的分离鉴定及致病性分析
作者:刘丁语;刘宝玲;何振文;罗琴;乔常宏;陈翔宇;王晓虎;向华;王刚;谭臣;蔡汝健
关键词:仔猪脑膜炎;猪链球菌;分离鉴定;耐药性;致病性
-
猪繁殖与呼吸综合征病毒诱导的炎症反应及抗炎药物研究进展
作者:乔常宏;陈晶;罗琴;刘宝玲;何振文;刘丁语;陈翔宇;王晓虎;王刚;白挨泉;蔡汝健
关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV);炎症反应;细胞因子;抗炎药物
-
不同磷胁迫处理转OsPHR2小麦的转录组学分析
作者:李艳;方宇辉;王永霞;彭超军;华夏;齐学礼;胡琳;许为钢
关键词:低磷胁迫;转基因小麦;转录组;磷素吸收利用效率;差异表达基因
-
灌浆期干旱胁迫对不同小麦品种的生理性状与根系生长的影响
作者:薛鑫雨;詹文博;陈新宜;周瑞祥;王永霞;薛瑞丽;李华;汪月霞;李艳
关键词:小麦;干旱胁迫;根;保护酶;基因表达调控
-
戊型肝炎病毒跨物种传播和防控技术研究进展
作者:何振文;刘丁语;刘宝玲;张翩;王晓虎;王刚;黄元;陈晶;杜宗亮;蔡汝健
关键词:戊型肝炎病毒(HEV);人兽共患病;跨物种传播;防控技术