猪伪狂犬病毒TK基因的扩增及序列分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 林鸷
作者: 林鸷;何锡忠;潘洁;朱永军;彭丽英
作者机构:
关键词: 伪狂犬病毒;TK基因;序列分析
期刊名称: 上海农业学报
ISSN: 1000-3924
年卷期: 2020 年 36 卷 03 期
页码: 47-51
摘要: 为了解猪伪狂犬病毒TK基因的分子特征及分子流行病学特点,利用PCR对猪伪狂犬病毒SX株TK基因进行扩增和测序,并将测序结果与国内外经典毒株、疫苗毒株以及近些年的变异毒株进行序列比对分析。结果表明:SX株TK基因序列包含963 bp的编码区,共编码320个氨基酸;与国内流行的变异毒株核苷酸和氨基酸同源性为100%,与国内外其他经典毒株核苷酸同源性在99.4%—99.7%,氨基酸同源性在99.1%—99.7%。与经典毒株相比,变异毒株TK基因编码的蛋白大部分都出现了第215位由苏氨酸(T)突变为缬氨酸(V)和第284位由丙氨酸(A)突变为缬氨酸(V)。氨基酸进化分析也表明,SX株及变异毒株与经典毒株呈现各自独立的遗传进化分支。
分类号: S852.65
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