甜玉米液泡转化酶2基因克隆及其等位变异分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 高玉尧

作者： 高玉尧;刘洋;姚艳丽;张秀梅

作者机构： 中国热带农业科学院

关键词： 甜玉米;基因克隆;生物信息学分析;ZsVINV2

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 21 卷 019 期

页码： 6285-6291

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了探究液泡转化酶2(vacuolar invertase 2,VINV2)基因在甜玉米中的等位变异情况,本研究从高糖甜玉米自交系'B-024'和低糖甜玉米自交系'B-029'中分离了 VINV2等位基因(ZsVINV2-a和ZsVINV2-b)cDNA序列,并对其基因序列、蛋白理化性质、保守结构域与跨膜结构及同源进化关系等进行生物信息学分析.结果显示,ZsVINV2-a和ZsVINV2-b基因最大开放阅读框分别为2 022和2 031 bp,分别编码673和676个氨基酸,且存在2处In/Del和16个SNP,其中1处In/Del存在12个碱基的插入或缺失;ZsVINV2-a和ZsVINV2-b均属于稳定的亲水性蛋白,它们的蛋白分子量分别为72 975.67和73 208.95 Da,且ZsVINV2-a的等电点略低于ZsVINV2-b;这2个蛋白具有糖基水解酶家族32的保守结构域,均在N端有β-呋喃果糖苷酶基序和在C端有半胱氨酸催化结构域;且膜上均有1个跨膜结构域,分别位于氨基酸第41~63处和第43~65处,均属于跨膜蛋白;甜玉米ZsVINV2蛋白与普通玉米的进化关系最为相近,蛋白序列同源性为95%,其次是高粱、谷子及粟等,可见ZsVINV2蛋白的进化高度保守.研究结果将为进一步了解ZsVINV2基因的等位变异在甜玉米类糖分积累中的作用提供理论支持.

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