水稻CesA/Csl基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 吴荣菊

作者： 吴荣菊;陈能刚;李欢;鄢小青;杨占烈;刘军

作者机构：

关键词： 水稻;纤维素合成酶;全基因组鉴定;生物信息学

期刊名称： 中国农业科技导报

ISSN： 1008-0864

年卷期： 2025 年 27 卷 011 期

页码： 83-92

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 水稻纤维素合成酶超基因家族由纤维素合成酶基因(cellulose synthase,CesA)和类纤维素合酶基因(cellulose synthase-like protein,Csl)组成,为了解水稻CesA/Csl家族成员序列特征及表达特性,探究其功能,利用生物信息学方法在水稻全基因组中鉴定OsCesA/Csl基因,并对其理化性质、保守基序、基因结构、系统进化、顺式作用元件、染色体定位和共线性等进行分析,利用转录组数据分析OsCesA/Csl的组织表达和不同植物激素处理下的表达.结果表明,在水稻基因组中共鉴定到22个OsCesA/Csl成员,基因编码序列(coding sequence,CDS)长度为774~3 648 bp,蛋白质分子量为28.55~132.16 kD,等电点为6.09~9.62,平均亲水系数为-0.339~0.750,亚细胞定位在细胞膜或高尔基体上.系统进化分为OsCesA和OsCsl,各包含11个成员,分布在除第11号以外的11条染色体上.水稻中存在2组串联重复基因,与玉米更具共线性关系.不同OsCesA/Csl成员的组织表达模式不同,均不同程度地响应茉莉酸、脱落酸、赤霉素和生长素处理.以上研究结果为进一步探索OsCesA/Csl基因家族在水稻生长发育中的功能奠定基础.

分类号： S511%Q781

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