基于RNA-Seq技术的向日葵油酸形成的转录组学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 于海峰

作者： 于海峰;韩平安;李美娜;陈阜;郭树春;李素萍;张艳芳;赵建军;闫明霞

作者机构：

关键词： 向日葵;油酸;RNA-Seq;形成机理

期刊名称： 中国油料作物学报

ISSN： 1007-9084

年卷期： 2018 年 06 期

页码： 769-776

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为探讨向日葵油酸调控机理,以高油酸材料J9和低油酸材料NK244为研究对象,在授粉后20d取材,采用RNA-Seq技术研究转录组。经比较分析,2个材料共鉴定到差异表达基因(DET)5 447个,其中上调表达基因2 709个,下调表达基因2 738个。对DET进行生物信息学分析,GO信息分析表明,有2 218个DET富集到57个功能条目,其中上调表达基因主要涉及催化活性、异构酶活性、碳水化合物结合、DNA结合、脂结合、碳水化合物过程、脂代谢过程和脂肪酸生物合成等;下调表达基因主要涉及蛋白激酶活性、ATP结合、蛋白磷酸化、tRNA氨酰化的蛋白质翻译和纤维素生物合成过程。KEGG分析中799个差异表达片段被显著富集在28个通路,主要为碳水化合物代谢通路和脂代谢通路。

分类号： S565.5

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